92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1184 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1184  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  100 
 
 		 86 aa  169  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1616  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  47.13 
 
 		 100 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1301  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  46.81 
 
 		 96 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1944  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  46.15 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0079  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  50 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0900  ethanolamine utilization protein EutN  53.01 
 
 		 90 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1294  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  43.82 
 
 		 99 aa  77  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.799614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2637  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  50.6 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1623  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  47.78 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1598  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  47.78 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1172  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  53.01 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1753  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  40 
 
 		 120 aa  72.8  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183919  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1365  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  48.81 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4897  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  50 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0362  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  51.19 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0912  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  49.4 
 
 		 89 aa  71.6  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3273  ethanolamine utilization protein eutN  50.59 
 
 		 91 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3271  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  48.78 
 
 		 86 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0201  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  50.56 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4862  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.36 
 
 		 97 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1370  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  47.67 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1048  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  52.5 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3850  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  46.51 
 
 		 100 aa  68.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.715247  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4036  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  45.78 
 
 		 96 aa  68.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4100  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  45.78 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4470  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  42.86 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1422  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmL  45.24 
 
 		 99 aa  67  0.00000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0125943  normal  0.634835 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2290  propanediol utilization protein PduN  42.05 
 
 		 91 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3677  ethanolamine utilization protein  39.29 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02309  hypothetical protein  39.29 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1221  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.29 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2602  ethanolamine utilization protein  39.29 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2733  ethanolamine utilization protein  39.29 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2585  ethanolamine utilization protein  39.29 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2822  ethanolamine utilization protein  39.29 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1214  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.29 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02347  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  39.29 
 
 		 95 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0502  putative ethanolamine utilization protein EutN  37.78 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2385  propanediol utilization protein  42.53 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2172  propanediol utilization domain protein  42.53 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2219  propanediol utilization protein  42.53 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2272  polyhedral body protein  42.53 
 
 		 91 aa  62  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0235595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2226  propanediol utilization protein (pduK)  42.53 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1234  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  42.05 
 
 		 101 aa  62  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1425  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  37.21 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5814  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.76 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2609  ethanolamine utilization protein  38.82 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2724  ethanolamine utilization protein  38.82 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.517543 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2657  ethanolamine utilization protein  38.82 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.940211  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1863  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  41.67 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519953  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5569  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein CcmL  41.25 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.738855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1239  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein CcmL  41.25 
 
 		 81 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.012777  hitchhiker  0.000912952 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1738  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  41.86 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0183  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.76 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.336746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0203  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.76 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0194  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.76 
 
 		 84 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4425  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  37.08 
 
 		 92 aa  52  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.165351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1884  putative carboxysome peptide B  41.25 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06091  putative carboxysome peptide B  41.25 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3199  carboxysome protein A  38.75 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0862  carboxysome peptide A  41.67 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.298797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08141  putative carboxysome peptide B  37.5 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05571  putative carboxysome peptide B  38.75 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1610  putative carboxysome peptide A  37.5 
 
 		 104 aa  47.8  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.306555  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2645  carboxysome peptide A  36.25 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0756  putative carboxysome peptide A  37.5 
 
 		 103 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.324398  normal  0.114801 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06111  putative carboxysome peptide B  38.75 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.466585  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0555  putative carboxysome peptide B  38.75 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.672365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2346  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.78 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000115401  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0757  putative carboxysome peptide B  37.5 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.316991  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05811  putative carboxysome peptide B  37.5 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1983  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.25 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06191  putative carboxysome peptide B  37.5 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0554  putative carboxysome peptide A  37.5 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06101  putative carboxysome peptide A  37.5 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06181  putative carboxysome peptide A  37.5 
 
 		 88 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05801  putative carboxysome peptide A  37.5 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1750  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.12 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.810666  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05561  putative carboxysome peptide A  37.5 
 
 		 86 aa  43.5  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0918  carboxysome peptide A  33.33 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1883  putative carboxysome peptide A  36.25 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06081  putative carboxysome peptide A  36.25 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.315065 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1982  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  35 
 
 		 84 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08131  putative carboxysome peptide A  35 
 
 		 91 aa  42  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0123  carboxysome peptide B  33.75 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2648  carboxysome protein A  35 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1687  carboxysome peptide A  34.94 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1385  carboxysome peptide A  34.94 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2647  carboxysome protein B  36.25 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1609  putative carboxysome peptide B  34.94 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0663  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.57 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217698  hitchhiker  0.00276842 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1296  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  28.57 
 
 		 88 aa  40  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243624  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>