65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1385 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1385  carboxysome peptide A  100 
 
 		 82 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1687  carboxysome peptide A  100 
 
 		 82 aa  166  1e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2648  carboxysome protein A  84.34 
 
 		 84 aa  146  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0862  carboxysome peptide A  80.49 
 
 		 83 aa  137  7e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.298797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3199  carboxysome protein A  79.52 
 
 		 85 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1983  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  75.9 
 
 		 85 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0918  carboxysome peptide A  77.78 
 
 		 83 aa  130  5e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0123  carboxysome peptide B  68.29 
 
 		 83 aa  121  3e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2645  carboxysome peptide A  71.95 
 
 		 96 aa  116  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0842  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  71.25 
 
 		 90 aa  113  7.999999999999999e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.852836  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4336  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  74.7 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05801  putative carboxysome peptide A  69.51 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06101  putative carboxysome peptide A  69.51 
 
 		 83 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06181  putative carboxysome peptide A  68.29 
 
 		 88 aa  108  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08131  putative carboxysome peptide A  68.29 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0554  putative carboxysome peptide A  68.29 
 
 		 83 aa  107  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05561  putative carboxysome peptide A  70.89 
 
 		 86 aa  107  5e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1883  putative carboxysome peptide A  67.07 
 
 		 91 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06081  putative carboxysome peptide A  67.07 
 
 		 91 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.315065 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1610  putative carboxysome peptide A  65.85 
 
 		 104 aa  103  6e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.306555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0756  putative carboxysome peptide A  65.85 
 
 		 103 aa  103  7e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.324398  normal  0.114801 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0843  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  48.75 
 
 		 84 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.989668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2646  carboxysome peptide B  45.12 
 
 		 86 aa  74.3  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05571  putative carboxysome peptide B  43.9 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1609  putative carboxysome peptide B  42.68 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179177  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1686  carboxysome peptide B  48.1 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021428  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1384  carboxysome peptide B  48.1 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0863  carboxysome peptide B  44.44 
 
 		 110 aa  68.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.338106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06091  putative carboxysome peptide B  42.68 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1884  putative carboxysome peptide B  42.68 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08141  putative carboxysome peptide B  42.68 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06111  putative carboxysome peptide B  40.24 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.466585  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0757  putative carboxysome peptide B  42.68 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.316991  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0555  putative carboxysome peptide B  40.24 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.672365  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05811  putative carboxysome peptide B  40.24 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2647  carboxysome protein B  44.3 
 
 		 105 aa  64.3  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06191  putative carboxysome peptide B  39.02 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1982  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  40.24 
 
 		 84 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0917  carboxysome peptide B  39.24 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4337  microcompartments protein  40.24 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3198  hypothetical protein  40.51 
 
 		 107 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.457559  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2657  ethanolamine utilization protein  34.94 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.940211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2724  ethanolamine utilization protein  34.94 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.517543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2609  ethanolamine utilization protein  34.94 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3677  ethanolamine utilization protein  34.94 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02309  hypothetical protein  34.94 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1214  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.94 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2822  ethanolamine utilization protein  34.94 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2602  ethanolamine utilization protein  34.94 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02347  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  34.94 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2585  ethanolamine utilization protein  34.94 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1221  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.94 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2733  ethanolamine utilization protein  34.94 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1294  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  35.96 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.799614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1234  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  35.29 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1370  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  32.95 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3850  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.09 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.715247  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4036  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  35.23 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1184  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.94 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1172  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  37.35 
 
 		 88 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1753  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  31.91 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183919  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3273  ethanolamine utilization protein eutN  40.62 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1623  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  32.53 
 
 		 101 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1598  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  32.53 
 
 		 101 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1616  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.09 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>