56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2647 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2647  carboxysome protein B  100 
 
 		 105 aa  214  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1686  carboxysome peptide B  76.25 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021428  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1384  carboxysome peptide B  76.25 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0917  carboxysome peptide B  68.35 
 
 		 81 aa  114  5e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4337  microcompartments protein  65 
 
 		 82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0863  carboxysome peptide B  55.34 
 
 		 110 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.338106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3198  hypothetical protein  63.53 
 
 		 107 aa  107  7.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.457559  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1982  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  60 
 
 		 84 aa  100  6e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1884  putative carboxysome peptide B  59.04 
 
 		 83 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06091  putative carboxysome peptide B  59.04 
 
 		 83 aa  97.4  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06191  putative carboxysome peptide B  56.25 
 
 		 82 aa  95.9  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0757  putative carboxysome peptide B  60 
 
 		 83 aa  95.9  2e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.316991  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0555  putative carboxysome peptide B  56.25 
 
 		 82 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.672365  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06111  putative carboxysome peptide B  56.25 
 
 		 82 aa  94.4  5e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.466585  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05811  putative carboxysome peptide B  55 
 
 		 82 aa  93.6  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1609  putative carboxysome peptide B  58.23 
 
 		 83 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179177  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05571  putative carboxysome peptide B  59.49 
 
 		 83 aa  92.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08141  putative carboxysome peptide B  58.23 
 
 		 83 aa  90.1  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0843  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  50.63 
 
 		 84 aa  80.9  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.989668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2646  carboxysome peptide B  55.7 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0123  carboxysome peptide B  47.5 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2645  carboxysome peptide A  49.38 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05801  putative carboxysome peptide A  48.75 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06101  putative carboxysome peptide A  48.75 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06181  putative carboxysome peptide A  48.75 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0554  putative carboxysome peptide A  48.75 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06081  putative carboxysome peptide A  47.5 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.315065 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1883  putative carboxysome peptide A  47.5 
 
 		 91 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08131  putative carboxysome peptide A  47.5 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05561  putative carboxysome peptide A  45.24 
 
 		 86 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1385  carboxysome peptide A  44.3 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1687  carboxysome peptide A  44.3 
 
 		 82 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0918  carboxysome peptide A  45.68 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0756  putative carboxysome peptide A  45 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.324398  normal  0.114801 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1610  putative carboxysome peptide A  45 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.306555  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1983  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  46.91 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0842  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  45.12 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.852836  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2648  carboxysome protein A  45 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3199  carboxysome protein A  44.71 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0862  carboxysome peptide A  44.44 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.298797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4336  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  48.15 
 
 		 85 aa  51.6  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02309  hypothetical protein  32.14 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3677  ethanolamine utilization protein  32.14 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1214  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  32.14 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2822  ethanolamine utilization protein  32.14 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2602  ethanolamine utilization protein  32.14 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1221  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  32.14 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2733  ethanolamine utilization protein  32.14 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2585  ethanolamine utilization protein  32.14 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02347  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  32.14 
 
 		 95 aa  44.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2609  ethanolamine utilization protein  32.14 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2724  ethanolamine utilization protein  32.14 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.517543 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2657  ethanolamine utilization protein  32.14 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.940211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1184  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.25 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4036  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  33.33 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1234  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  35.29 
 
 		 101 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>