84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2645 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2645  carboxysome peptide A  100 
 
 		 96 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3199  carboxysome protein A  68.24 
 
 		 85 aa  117  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1385  carboxysome peptide A  71.95 
 
 		 82 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1687  carboxysome peptide A  71.95 
 
 		 82 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0862  carboxysome peptide A  68.29 
 
 		 83 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.298797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2648  carboxysome protein A  65.85 
 
 		 84 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0123  carboxysome peptide B  67.07 
 
 		 83 aa  108  3e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0842  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  65.06 
 
 		 90 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.852836  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1983  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  66.67 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0554  putative carboxysome peptide A  70.37 
 
 		 83 aa  107  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06101  putative carboxysome peptide A  70.37 
 
 		 83 aa  106  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06181  putative carboxysome peptide A  70.37 
 
 		 88 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0918  carboxysome peptide A  64.2 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05801  putative carboxysome peptide A  66.67 
 
 		 83 aa  105  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06081  putative carboxysome peptide A  66.67 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.315065 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1883  putative carboxysome peptide A  66.67 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08131  putative carboxysome peptide A  66.67 
 
 		 91 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05561  putative carboxysome peptide A  60.23 
 
 		 86 aa  104  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1610  putative carboxysome peptide A  61.73 
 
 		 104 aa  93.6  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.306555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0756  putative carboxysome peptide A  61.73 
 
 		 103 aa  93.6  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.324398  normal  0.114801 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4336  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  64.2 
 
 		 85 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1384  carboxysome peptide B  55.29 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1686  carboxysome peptide B  55.29 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021428  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0863  carboxysome peptide B  48.89 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.338106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0757  putative carboxysome peptide B  46.91 
 
 		 83 aa  71.2  0.000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.316991  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06191  putative carboxysome peptide B  46.99 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3198  hypothetical protein  48.1 
 
 		 107 aa  70.1  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.457559  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05811  putative carboxysome peptide B  46.43 
 
 		 82 aa  70.5  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2646  carboxysome peptide B  47.13 
 
 		 86 aa  70.1  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06111  putative carboxysome peptide B  46.99 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.466585  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0555  putative carboxysome peptide B  46.99 
 
 		 82 aa  70.1  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.672365  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08141  putative carboxysome peptide B  49.38 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2647  carboxysome protein B  49.38 
 
 		 105 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0843  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  48.78 
 
 		 84 aa  68.2  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.989668  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1609  putative carboxysome peptide B  46.91 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179177  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05571  putative carboxysome peptide B  49.4 
 
 		 83 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0917  carboxysome peptide B  45 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06091  putative carboxysome peptide B  41.98 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1884  putative carboxysome peptide B  41.98 
 
 		 83 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4337  microcompartments protein  42.17 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02309  hypothetical protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2822  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2602  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1221  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.76 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3677  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1214  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.76 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2733  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02347  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2585  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2657  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.940211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2609  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2724  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.517543 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1982  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  38.55 
 
 		 84 aa  54.3  0.0000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4036  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.05 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3850  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  37.35 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.715247  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2226  propanediol utilization protein (pduK)  32.58 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2272  polyhedral body protein  32.58 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0235595 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2219  propanediol utilization protein  32.58 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2172  propanediol utilization domain protein  32.58 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2385  propanediol utilization protein  32.58 
 
 		 91 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1370  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.94 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1738  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  35.96 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1184  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.25 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1234  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  40.48 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1172  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.05 
 
 		 88 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1048  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  45 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4470  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.52 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1422  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmL  34.94 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0125943  normal  0.634835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1623  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.94 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1863  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.9 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519953  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2290  propanediol utilization protein PduN  30.34 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1598  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.94 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0900  ethanolamine utilization protein EutN  36.05 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2346  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.08 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000115401  hitchhiker  0.00320491 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3273  ethanolamine utilization protein eutN  40.96 
 
 		 91 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1616  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  33.73 
 
 		 100 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4100  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  33.72 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1944  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  32.26 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1753  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  31.91 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1294  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  32.61 
 
 		 99 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.799614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0502  putative ethanolamine utilization protein EutN  30 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0912  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  33.72 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4425  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  37.35 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.165351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0201  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  33.68 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>