72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9515_06191 on replicon NC_008817
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9515



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_06191  putative carboxysome peptide B  100 
 
 		 82 aa  171  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05811  putative carboxysome peptide B  95 
 
 		 82 aa  160  5.0000000000000005e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06111  putative carboxysome peptide B  91.46 
 
 		 82 aa  160  7e-39  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.466585  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0555  putative carboxysome peptide B  91.46 
 
 		 82 aa  160  7e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.672365  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05571  putative carboxysome peptide B  85.37 
 
 		 83 aa  150  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08141  putative carboxysome peptide B  81.71 
 
 		 83 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1884  putative carboxysome peptide B  78.05 
 
 		 83 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06091  putative carboxysome peptide B  78.05 
 
 		 83 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0757  putative carboxysome peptide B  76.83 
 
 		 83 aa  134  3.0000000000000003e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.316991  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1609  putative carboxysome peptide B  73.17 
 
 		 83 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179177  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0863  carboxysome peptide B  63.75 
 
 		 110 aa  107  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.338106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3198  hypothetical protein  59.49 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.457559  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2647  carboxysome protein B  56.25 
 
 		 105 aa  95.9  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0917  carboxysome peptide B  55.7 
 
 		 81 aa  94.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1384  carboxysome peptide B  51.22 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1686  carboxysome peptide B  51.22 
 
 		 88 aa  92.8  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021428  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1982  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  56.25 
 
 		 84 aa  92.4  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4337  microcompartments protein  53.75 
 
 		 82 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0843  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  47.56 
 
 		 84 aa  88.2  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.989668  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2646  carboxysome peptide B  47.5 
 
 		 86 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1610  putative carboxysome peptide A  47.56 
 
 		 104 aa  74.3  0.0000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.306555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0756  putative carboxysome peptide A  47.56 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.324398  normal  0.114801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2645  carboxysome peptide A  46.99 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0123  carboxysome peptide B  41.46 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06181  putative carboxysome peptide A  45.12 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06101  putative carboxysome peptide A  43.9 
 
 		 83 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05801  putative carboxysome peptide A  43.9 
 
 		 83 aa  68.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08131  putative carboxysome peptide A  43.9 
 
 		 91 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05561  putative carboxysome peptide A  43.9 
 
 		 86 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06081  putative carboxysome peptide A  43.9 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.315065 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1883  putative carboxysome peptide A  43.9 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0554  putative carboxysome peptide A  43.75 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0862  carboxysome peptide A  45.68 
 
 		 83 aa  64.3  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.298797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1983  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  43.9 
 
 		 85 aa  63.9  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3199  carboxysome protein A  44.44 
 
 		 85 aa  63.5  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1687  carboxysome peptide A  39.02 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1385  carboxysome peptide A  39.02 
 
 		 82 aa  62.8  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2648  carboxysome protein A  43.37 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0842  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  44.44 
 
 		 90 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.852836  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0918  carboxysome peptide A  41.25 
 
 		 83 aa  57  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1214  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.76 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02309  hypothetical protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3677  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2822  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1221  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.76 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02347  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2585  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2733  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2602  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2724  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.517543 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2657  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.940211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2609  ethanolamine utilization protein  39.76 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4336  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  42.68 
 
 		 85 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1234  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  38.1 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0201  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.08 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4036  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  37.5 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1048  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  40.96 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2290  propanediol utilization protein PduN  35.16 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1184  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  37.5 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4470  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.29 
 
 		 101 aa  43.9  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2385  propanediol utilization protein  34.09 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2172  propanediol utilization domain protein  34.09 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2219  propanediol utilization protein  34.09 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2226  propanediol utilization protein (pduK)  34.09 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0663  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  35.62 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.217698  hitchhiker  0.00276842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3850  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  37.35 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.715247  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2272  polyhedral body protein  34.09 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0235595 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4100  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  31.82 
 
 		 90 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1753  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  28.87 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.183919  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1623  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  37.35 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1598  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  37.35 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3273  ethanolamine utilization protein eutN  34.94 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>