67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_08131 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_08131  putative carboxysome peptide A  100 
 
 		 91 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1883  putative carboxysome peptide A  92.22 
 
 		 91 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.909228  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06081  putative carboxysome peptide A  92.22 
 
 		 91 aa  172  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.315065 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06181  putative carboxysome peptide A  90.8 
 
 		 88 aa  164  5e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05561  putative carboxysome peptide A  95.12 
 
 		 86 aa  162  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06101  putative carboxysome peptide A  96.3 
 
 		 83 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05801  putative carboxysome peptide A  96.3 
 
 		 83 aa  159  1e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0554  putative carboxysome peptide A  93.83 
 
 		 83 aa  156  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0756  putative carboxysome peptide A  90.12 
 
 		 103 aa  149  1e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.324398  normal  0.114801 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1610  putative carboxysome peptide A  90.12 
 
 		 104 aa  149  2e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.306555  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1687  carboxysome peptide A  68.29 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1385  carboxysome peptide A  68.29 
 
 		 82 aa  108  3e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0918  carboxysome peptide A  67.9 
 
 		 83 aa  106  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3199  carboxysome protein A  67.47 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.419695  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2645  carboxysome peptide A  66.67 
 
 		 96 aa  104  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0862  carboxysome peptide A  69.14 
 
 		 83 aa  104  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.298797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1983  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  65.06 
 
 		 85 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2648  carboxysome protein A  63.86 
 
 		 84 aa  103  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0842  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  69.14 
 
 		 90 aa  102  2e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.852836  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0123  carboxysome peptide B  60.24 
 
 		 83 aa  97.4  6e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4336  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  65.48 
 
 		 85 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1384  carboxysome peptide B  51.85 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1686  carboxysome peptide B  51.85 
 
 		 88 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021428  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1609  putative carboxysome peptide B  44.58 
 
 		 83 aa  72.4  0.000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.179177  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3198  hypothetical protein  44.21 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.457559  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0757  putative carboxysome peptide B  43.37 
 
 		 83 aa  70.5  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.316991  normal  0.119617 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06091  putative carboxysome peptide B  42.68 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.307472 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1884  putative carboxysome peptide B  42.68 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2646  carboxysome peptide B  48.1 
 
 		 86 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08141  putative carboxysome peptide B  43.37 
 
 		 83 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06191  putative carboxysome peptide B  43.9 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06111  putative carboxysome peptide B  43.9 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.466585  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0555  putative carboxysome peptide B  43.9 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.672365  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05571  putative carboxysome peptide B  42.17 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05811  putative carboxysome peptide B  43.9 
 
 		 82 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2647  carboxysome protein B  47.5 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0863  carboxysome peptide B  43.53 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.338106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0843  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  44.44 
 
 		 84 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.989668  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0917  carboxysome peptide B  41.77 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4337  microcompartments protein  39.76 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1982  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.14 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2657  ethanolamine utilization protein  33.73 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.940211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2724  ethanolamine utilization protein  33.73 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.517543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2609  ethanolamine utilization protein  33.73 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1616  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.9 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02309  hypothetical protein  33.67 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3677  ethanolamine utilization protein  33.67 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1214  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  33.67 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2822  ethanolamine utilization protein  33.67 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02347  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  33.67 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2602  ethanolamine utilization protein  33.67 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1221  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  33.67 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2733  ethanolamine utilization protein  33.67 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2585  ethanolamine utilization protein  33.67 
 
 		 95 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0201  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.44 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1234  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.47 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3850  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.94 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.715247  normal  0.0695894 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3273  ethanolamine utilization protein eutN  38.1 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1184  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  35 
 
 		 86 aa  42  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1863  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  39.29 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.519953  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1294  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  30.43 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.799614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1623  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.94 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.631058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4425  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.17 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.165351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1598  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.94 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1370  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  31.91 
 
 		 103 aa  40.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1048  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  40.96 
 
 		 82 aa  40.4  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4470  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.9 
 
 		 101 aa  40  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.340064  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>