36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1750 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1750  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  100 
 
 		 85 aa  169  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.810666  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1296  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.47 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4100  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  38.82 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0912  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.47 
 
 		 89 aa  57  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4036  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  35.29 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3677  ethanolamine utilization protein  34.52 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2822  ethanolamine utilization protein  34.52 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02309  hypothetical protein  34.52 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02347  predicted carboxysome structural protein, ethanolamine utilization protein  34.52 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2602  ethanolamine utilization protein  34.52 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1221  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.52 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1214  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.52 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2733  ethanolamine utilization protein  34.52 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2585  ethanolamine utilization protein  34.52 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2657  ethanolamine utilization protein  33.33 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.940211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2724  ethanolamine utilization protein  33.33 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.447627  normal  0.517543 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2609  ethanolamine utilization protein  33.33 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4426  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.18 
 
 		 127 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.193786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4862  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  28.26 
 
 		 97 aa  47.8  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1172  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  36.47 
 
 		 88 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1944  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  35.16 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1294  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  31.11 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.799614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0900  ethanolamine utilization protein EutN  31.76 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0201  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  29.55 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1616  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  32.14 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1184  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.12 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2219  propanediol utilization protein  30.68 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2385  propanediol utilization protein  30.68 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2172  propanediol utilization domain protein  30.68 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2272  polyhedral body protein  30.68 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0235595 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2226  propanediol utilization protein (pduK)  30.68 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2290  propanediol utilization protein PduN  30.68 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2637  ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  34.12 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1422  carbon dioxide concentrating mechanism protein CcmL  30.95 
 
 		 99 aa  41.2  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0125943  normal  0.634835 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5814  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  26.19 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.825864 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1365  Ethanolamine utilization protein EutN/carboxysome structural protein Ccml  27.38 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>