17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0822 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0822  type III restriction-modification system restriction subunit  100 
 
 		 52 aa  109  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.442132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1948  type III restriction protein res subunit  52.08 
 
 		 982 aa  57  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4592  Type III site-specific deoxyribonuclease  59.46 
 
 		 997 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0849  Type III site-specific deoxyribonuclease  48.72 
 
 		 998 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3046  Type III site-specific deoxyribonuclease  48.72 
 
 		 994 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0515  type III restriction enzyme, res subunit  55.1 
 
 		 877 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4204  type III restriction protein res subunit  64.71 
 
 		 1001 aa  45.1  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.416822  normal  0.0251436 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1130  type III restriction system endonuclease  43.64 
 
 		 991 aa  44.7  0.0005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0236  type III restriction enzyme, res subunit  51.11 
 
 		 991 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0226  type III restriction protein res subunit  50 
 
 		 887 aa  42.4  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000256753 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05380  restriction endonuclease  54.05 
 
 		 1001 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224122  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0155  type III restriction protein res subunit  55.88 
 
 		 1009 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.156015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0518  type III restriction enzyme, res subunit  48.94 
 
 		 991 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0162  type III restriction enzyme, res subunit  55.56 
 
 		 998 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000922186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1547  type III restriction system endonuclease  46.94 
 
 		 989 aa  40.8  0.007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1742  type III restriction system endonuclease  42.86 
 
 		 990 aa  40.4  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109484  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1393  type III restriction protein res subunit  40 
 
 		 993 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>