33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2479 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2479  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 92 aa  187  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2485  excinuclease ABC subunit C  98.91 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2484  excinuclease ABC subunit C  98.91 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2483  excinuclease ABC subunit C  98.91 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2482  excinuclease ABC subunit C  98.91 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2480  excinuclease ABC subunit C  98.91 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2486  excinuclease ABC subunit C  98.91 
 
 		 92 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2481  hypothetical protein  96.74 
 
 		 92 aa  181  3e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0181  excinuclease ABC, C subunit domain protein  60.24 
 
 		 83 aa  103  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4364  putative excinuclease ABC protein, C subunit  43.08 
 
 		 69 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0179482 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1158  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 		 93 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  32.47 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2985  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.38 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00056528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3661  excinuclease ABC subunit C  39.71 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.902012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0062  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.62 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.330089  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0402  excinuclease ABC subunit C  34.25 
 
 		 78 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0671  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.17 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807628  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  35.9 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  36.11 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  35.82 
 
 		 95 aa  43.9  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0210  hypothetical protein  37.68 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1593  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.25 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.758459 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  32.39 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  41.79 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.39 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1965  excinuclease ABC subunit C  36.76 
 
 		 95 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.70444 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  36.23 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.06 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  30.38 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  34.85 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1816  excinuclease ABC, C subunit-like protein  30.14 
 
 		 79 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>