23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1816 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1816  excinuclease ABC, C subunit-like protein  100 
 
 		 79 aa  164  2.9999999999999998e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0402  excinuclease ABC subunit C  55.13 
 
 		 78 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0062  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.85 
 
 		 78 aa  93.6  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.330089  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1935  excinuclease ABC subunit C  54.43 
 
 		 113 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.517176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2985  Excinuclease ABC C subunit domain protein  53.16 
 
 		 80 aa  84.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00056528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0107  hypothetical protein  53.95 
 
 		 83 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.629422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4364  putative excinuclease ABC protein, C subunit  52.17 
 
 		 69 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0179482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1944  Excinuclease ABC C subunit domain protein  41.03 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1593  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.24 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.758459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0671  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.36 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807628  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0210  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2997  excinuclease ABC subunit C  40.58 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.867299  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.84 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1603  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.94 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000181458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  40.62 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  40.3 
 
 		 86 aa  41.2  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  37.14 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4162  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.06 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1602  excinuclease ABC subunit C  34.18 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5558  excinuclease ABC subunit C  38.33 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0181  excinuclease ABC, C subunit domain protein  32.81 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1158  excinuclease ABC subunit C  30.67 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2479  excinuclease ABC subunit C  30.14 
 
 		 92 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>