17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1158 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1158  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
93 aa  192  2e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0210  hypothetical protein  36.36 
 
 
81 aa  48.9  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2479  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 
92 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1593  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.25 
 
 
95 aa  47.4  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.758459 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2480  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2482  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2483  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2484  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2485  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2486  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 
92 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1944  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.5 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.752306 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0181  excinuclease ABC, C subunit domain protein  30.88 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0671  Excinuclease ABC C subunit domain protein  29.11 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807628  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2481  hypothetical protein  29.87 
 
 
92 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4364  putative excinuclease ABC protein, C subunit  36.23 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0179482 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0606  hypothetical protein  34.21 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.383877  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1816  excinuclease ABC, C subunit-like protein  30.67 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.406649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>