14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1935 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1935  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 113 aa  238  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.517176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2985  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.43 
 
 		 80 aa  98.2  4e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00056528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0107  hypothetical protein  53.75 
 
 		 83 aa  94  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.629422 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0402  excinuclease ABC subunit C  54.43 
 
 		 78 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1816  excinuclease ABC, C subunit-like protein  54.43 
 
 		 79 aa  89  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0062  Excinuclease ABC C subunit domain protein  54.43 
 
 		 78 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.330089  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4364  putative excinuclease ABC protein, C subunit  52.17 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0179482 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1944  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.24 
 
 		 84 aa  53.5  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752306 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  38.03 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0210  hypothetical protein  30.95 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1593  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.88 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.758459 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0671  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.84 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807628  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1901  excinuclease ABC subunit C  34.21 
 
 		 93 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.873761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90954  predicted protein  40.3 
 
 		 336 aa  40  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.919235  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>