24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0671 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0671  Excinuclease ABC C subunit domain protein  100 
 
 		 84 aa  178  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807628  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0402  excinuclease ABC subunit C  34.33 
 
 		 78 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1816  excinuclease ABC, C subunit-like protein  36.36 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0210  hypothetical protein  34.57 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03940  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.65 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3661  excinuclease ABC subunit C  28.92 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.902012  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0782  hypothetical protein  37.5 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0811  hypothetical protein  37.5 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1901  excinuclease ABC subunit C  37.14 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.873761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2486  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1158  excinuclease ABC subunit C  29.11 
 
 		 93 aa  43.9  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2485  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2484  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2483  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2482  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2480  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2479  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4146  Excinuclease ABC C subunit domain protein  32.5 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.824379  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1935  excinuclease ABC subunit C  32.84 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.517176  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0062  Excinuclease ABC C subunit domain protein  28.36 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.330089  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4364  putative excinuclease ABC protein, C subunit  33.82 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0179482 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3467  excinuclease ABC subunit C  32.5 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.506637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2481  hypothetical protein  31.17 
 
 		 92 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1944  Excinuclease ABC C subunit domain protein  28.36 
 
 		 84 aa  40.4  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752306 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>