22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0402 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0402  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 78 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0062  Excinuclease ABC C subunit domain protein  78.21 
 
 		 78 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.330089  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4364  putative excinuclease ABC protein, C subunit  68.12 
 
 		 69 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0179482 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2985  Excinuclease ABC C subunit domain protein  58.23 
 
 		 80 aa  96.7  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00056528  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1816  excinuclease ABC, C subunit-like protein  55.13 
 
 		 79 aa  94.7  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.406649 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1935  excinuclease ABC subunit C  54.43 
 
 		 113 aa  91.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.517176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0107  hypothetical protein  58.23 
 
 		 83 aa  88.6  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.629422 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1944  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.74 
 
 		 84 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.752306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0671  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.33 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807628  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1593  Excinuclease ABC C subunit domain protein  36.71 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.758459 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2479  excinuclease ABC subunit C  34.25 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  36.23 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0210  hypothetical protein  32.89 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2486  excinuclease ABC subunit C  32.88 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2485  excinuclease ABC subunit C  32.88 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2484  excinuclease ABC subunit C  32.88 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2483  excinuclease ABC subunit C  32.88 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2482  excinuclease ABC subunit C  32.88 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2480  excinuclease ABC subunit C  32.88 
 
 		 92 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1073  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.71 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0081744 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2481  hypothetical protein  31.51 
 
 		 92 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  35.38 
 
 		 115 aa  40  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>