31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2480 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2480  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
92 aa  187  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2482  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
92 aa  187  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2483  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
92 aa  187  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2484  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
92 aa  187  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2485  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
92 aa  187  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2486  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 
92 aa  187  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2479  excinuclease ABC subunit C  98.91 
 
 
92 aa  186  1e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2481  hypothetical protein  97.83 
 
 
92 aa  182  1.0000000000000001e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0181  excinuclease ABC, C subunit domain protein  60.24 
 
 
83 aa  102  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.191258  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4364  putative excinuclease ABC protein, C subunit  41.54 
 
 
69 aa  47  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0179482 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1648  excinuclease ABC subunit C  32.47 
 
 
117 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.732413  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1158  excinuclease ABC subunit C  31.17 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2985  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.85 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00056528  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3661  excinuclease ABC subunit C  38.24 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.902012  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0062  Excinuclease ABC C subunit domain protein  35.62 
 
 
78 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.330089  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0671  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.17 
 
 
84 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.807628  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0402  excinuclease ABC subunit C  32.88 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2317  excinuclease ABC subunit C  32.39 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0365776  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0651  excinuclease ABC subunit C  36.11 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0670127  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0771  excinuclease ABC subunit C  35.82 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.959878 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0210  hypothetical protein  37.68 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.101895  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0981  excinuclease ABC subunit C  34.62 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.16466  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3124  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.39 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80236  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0814  excinuclease ABC subunit C  36.99 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.683613  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1593  Excinuclease ABC C subunit domain protein  31.25 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.758459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3608  GIY-YIG nuclease superfamily protein  40.3 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.942188  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4335  Excinuclease ABC C subunit domain protein  30.38 
 
 
95 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0231895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2170  excinuclease ABC subunit C  34.85 
 
 
98 aa  40.8  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.013295  normal  0.490255 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2055  hypothetical protein  36.23 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0452  Excinuclease ABC C subunit domain protein  39.06 
 
 
84 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122957  normal  0.760356 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0254  excinuclease ABC subunit C  36.36 
 
 
107 aa  40  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.166444  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>