26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2239 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2239  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  159  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1481  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  100 
 
 		 418 aa  100  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.251743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4019  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  71.74 
 
 		 415 aa  77  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2112  RNA-directed DNA polymerase  68.09 
 
 		 413 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1245  RNA-directed DNA polymerase  68.09 
 
 		 413 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1076  RNA-directed DNA polymerase  68.09 
 
 		 413 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722331  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0963  RNA-directed DNA polymerase  68.09 
 
 		 413 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0470152  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0416  RNA-directed DNA polymerase  68.09 
 
 		 413 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2197  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  57.14 
 
 		 440 aa  70.5  0.000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.298068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0626  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  58.49 
 
 		 441 aa  65.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000304657  hitchhiker  0.00000002328 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2104  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  61.7 
 
 		 413 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0282857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0075  RNA-directed DNA polymerase  58.33 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1223  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  57.78 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0131896  normal  0.0593975 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6095  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  57.78 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5513  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  57.78 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.561681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4903  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  57.78 
 
 		 419 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.791512  normal  0.702459 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0245  RNA-directed DNA polymerase  48.94 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0629  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  55.56 
 
 		 411 aa  57.4  0.00000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4539  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  51.11 
 
 		 413 aa  50.8  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.605782  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1983  reverse transcriptase/retron type  46.81 
 
 		 105 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.103738  normal  0.967018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1979  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  47.83 
 
 		 417 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.312745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0653  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  47.83 
 
 		 417 aa  48.9  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.008692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6736  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  44.44 
 
 		 417 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.328111  normal  0.0394993 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3413  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  44.44 
 
 		 417 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.344584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0786  retron-type reverse transcriptase-like protein  40.82 
 
 		 309 aa  40.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2550  RNA-directed DNA polymerase (Reverse transcriptase)  45 
 
 		 422 aa  40  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0006691  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>