More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1830 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2419  8-amino-7-oxononanoate synthase  76.09 
 
 
419 aa  670    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.972813  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08121  8-amino-7-oxononanoate synthase  73.17 
 
 
417 aa  639    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1830  Glycine C-acetyltransferase  100 
 
 
420 aa  869    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.219608  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3321  8-amino-7-oxononanoate synthase  62.72 
 
 
413 aa  542  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.262021  normal  0.502232 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3535  Glycine C-acetyltransferase  61.37 
 
 
434 aa  538  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1310  2-amino-3-ketobutyrate CoA ligase (glycine acetyltransferase)  59.41 
 
 
414 aa  537  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.817113  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1664  Glycine C-acetyltransferase  61.88 
 
 
413 aa  537  1e-151  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3258  Glycine C-acetyltransferase  63.85 
 
 
404 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.124677 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0699  aminotransferase class I and II  38.99 
 
 
396 aa  262  8.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2195  Glycine C-acetyltransferase  35.25 
 
 
401 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880865  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1185  glycine C-acetyltransferase  37.04 
 
 
396 aa  256  4e-67  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0779  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  36.87 
 
 
395 aa  250  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0448  aminotransferase class I and II  34.38 
 
 
428 aa  247  3e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.341482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2397  Glycine C-acetyltransferase  35.1 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.135893  normal  0.0678456 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0292  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  36.34 
 
 
393 aa  243  5e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1549  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  37.27 
 
 
393 aa  243  5e-63  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000387483  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1780  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.41 
 
 
395 aa  241  2e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2194  8-amino-7-oxononanoate synthase, putative  36.41 
 
 
395 aa  235  1.0000000000000001e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1346  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  34.47 
 
 
391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.583033  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1307  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  35.7 
 
 
395 aa  233  7.000000000000001e-60  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2557  Glycine C-acetyltransferase  34.55 
 
 
403 aa  232  7.000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.470257  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0699  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.21 
 
 
395 aa  231  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0688  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.36 
 
 
396 aa  228  2e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0534  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.36 
 
 
396 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0573  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.21 
 
 
395 aa  225  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.709963  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0587  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.21 
 
 
395 aa  225  1e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.09 
 
 
396 aa  224  2e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0530  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.09 
 
 
396 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0748  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.09 
 
 
396 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00398054  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0675  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.09 
 
 
396 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.36128e-18 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0586  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.83 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0620  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.83 
 
 
396 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0657  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.09 
 
 
396 aa  223  6e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.111241  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4680  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  35.09 
 
 
396 aa  223  6e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.721634  hitchhiker  3.77656e-21 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0533  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.83 
 
 
396 aa  222  8e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.801462  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0831  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.63 
 
 
389 aa  222  9e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3430  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.6 
 
 
389 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0707061 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2207  Glycine C-acetyltransferase  34.22 
 
 
416 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.35112  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2235  glycine C-acetyltransferase  32.54 
 
 
424 aa  218  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0842  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.77 
 
 
396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1652  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.59 
 
 
393 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05000  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.46 
 
 
397 aa  216  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1835  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.59 
 
 
384 aa  216  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2298  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase, putative  31.84 
 
 
395 aa  216  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000248128  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1311  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.33 
 
 
402 aa  216  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.616211  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3246  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.03 
 
 
391 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0147  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  34.42 
 
 
395 aa  214  1.9999999999999998e-54  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0022  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.16 
 
 
388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0282575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8853  Glycine C-acetyltransferase  33.43 
 
 
390 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001212  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.18 
 
 
397 aa  213  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2629  8-amino-7-oxononanoate synthase  34.38 
 
 
391 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0669  glycine C-acetyltransferase  32.96 
 
 
446 aa  212  1e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.236778  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0443  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.07 
 
 
395 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.504807  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2306  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.77 
 
 
404 aa  211  1e-53  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0101  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.15 
 
 
397 aa  210  4e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.396382 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3158  putative serine palmitoyltransferase  32.35 
 
 
390 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3263  putative serine palmitoyltransferase  32.35 
 
 
390 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3445  aminotransferase, class I/II  32.35 
 
 
390 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5431  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.7 
 
 
407 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2045  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.32 
 
 
390 aa  207  2e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0152681  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02854  conserved hypothetical protein  32.09 
 
 
390 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000161764  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0715  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.09 
 
 
390 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02803  hypothetical protein  32.09 
 
 
390 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000119299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1570  8-amino-7-oxononanoate synthase  36.03 
 
 
501 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.537635  normal  0.306191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3709  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.11 
 
 
397 aa  206  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.556629  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1685  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.61 
 
 
405 aa  206  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.888348  normal  0.418034 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0088  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.24 
 
 
398 aa  206  8e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4990  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.24 
 
 
398 aa  206  8e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00350174  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4121  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.24 
 
 
398 aa  206  8e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.54608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4045  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.24 
 
 
398 aa  206  8e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00116611  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03475  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.24 
 
 
398 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0123868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3829  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.24 
 
 
398 aa  206  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155741  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03426  hypothetical protein  33.24 
 
 
398 aa  206  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00829119  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0091  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.24 
 
 
398 aa  206  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.541224  normal  0.282383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0049  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  32.97 
 
 
396 aa  205  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3954  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  33.24 
 
 
398 aa  205  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0183173  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1354  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  31.11 
 
 
398 aa  205  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000120772 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1967  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.51 
 
 
400 aa  205  1e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0107  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.69 
 
 
398 aa  204  2e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.407437  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0048  pyridoxal phosphate-dependent acyltransferase  32.97 
 
 
396 aa  204  2e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000159697 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1665  8-amino-7-oxononanoate synthase  35.5 
 
 
390 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000158621  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3901  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.5 
 
 
397 aa  204  2e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0192612  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0836  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.32 
 
 
398 aa  204  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0972896  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2767  8-amino-7-oxononanoate synthase  33.89 
 
 
399 aa  204  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3908  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.96 
 
 
398 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0785377 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4095  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.96 
 
 
398 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0257  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.73 
 
 
400 aa  203  4e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4034  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.96 
 
 
398 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3927  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.96 
 
 
398 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3989  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.96 
 
 
398 aa  203  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.879002  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1598  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  34.08 
 
 
400 aa  203  4e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.50805 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2579  8-amino-7-oxononanoate synthase  32.47 
 
 
400 aa  202  7e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4674  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.69 
 
 
397 aa  202  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0065  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.05 
 
 
397 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000130332  hitchhiker  0.000000319123 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4009  8-amino-7-oxononanoate synthase  31 
 
 
398 aa  201  9.999999999999999e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0774739  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0118  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.96 
 
 
398 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4285  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.69 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.560532  hitchhiker  0.0000435103 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0228  8-amino-7-oxononanoate synthase  32 
 
 
395 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00625814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4340  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.69 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4104  2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase  32.69 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0130063  normal  0.534575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>