168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1883 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_1883  acylneuraminate cytidylyltransferase  100 
 
 
225 aa  470  1e-132  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1594  acylneuraminate cytidylyltransferase  46.82 
 
 
238 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0054  acylneuraminate cytidylyltransferase  46.33 
 
 
231 aa  201  9e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0052  acylneuraminate cytidylyltransferase  46.33 
 
 
231 aa  201  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0163138  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14211  hypothetical protein  43.93 
 
 
219 aa  171  6.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4769  acylneuraminate cytidylyltransferase  41.98 
 
 
224 aa  167  8e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2838  acylneuraminate cytidylyltransferase  43.2 
 
 
232 aa  160  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0478291  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001797  N-Acetylneuraminate cytidylyltransferase  33.33 
 
 
230 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1132  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.31 
 
 
229 aa  106  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00677  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  31.56 
 
 
230 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0292  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  31.05 
 
 
225 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0292  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.05 
 
 
225 aa  102  5e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  31.13 
 
 
468 aa  96.7  3e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4089  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.42 
 
 
229 aa  95.9  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1278  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  27.11 
 
 
387 aa  94.4  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0975  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.25 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.02 
 
 
548 aa  94  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1024  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.12 
 
 
229 aa  92.8  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1581  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.96 
 
 
227 aa  92  7e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2217  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  29.39 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.454172  normal  0.965631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4941  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  27.11 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1484  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.32 
 
 
237 aa  89.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.51038  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0417  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.57 
 
 
229 aa  89  5e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0052  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.07 
 
 
230 aa  88.6  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0634  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  26.22 
 
 
228 aa  87.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.684247  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1790  acylneuraminate cytidylyltransferase, putative  29.74 
 
 
231 aa  85.1  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07300  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.56 
 
 
227 aa  85.1  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1514  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.89 
 
 
233 aa  85.1  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2336  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  30 
 
 
232 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.177119  normal  0.565326 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1387  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.82 
 
 
241 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.661123  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4264  pseudaminic acid CMP-transferase  28.31 
 
 
233 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.468178 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0364  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.19 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0462  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  28.98 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0307  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.28 
 
 
221 aa  77.8  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.245282  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3125  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  26.96 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2981  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  26.96 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0478934  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2324  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.67 
 
 
236 aa  76.3  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.380587 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0009  putative transferase  23.64 
 
 
383 aa  75.5  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.848658  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36315  predicted protein  26.39 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412907  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3030  pseudaminic acid CMP-transferase  24.89 
 
 
232 aa  73.9  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4851  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.84 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3094  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.89 
 
 
226 aa  72.8  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0021  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.83 
 
 
233 aa  72  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0722  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  27.56 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2299  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  26.29 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.941163  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1455  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.32 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0599  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.55 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.233395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0087  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.88 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.770014  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3550  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.88 
 
 
236 aa  68.9  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.271433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  24.74 
 
 
672 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0148  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.55 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1387  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.23 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00882869 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2094  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  25.56 
 
 
231 aa  68.2  0.00000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0507  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.43 
 
 
240 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1229  flagellin modification protein PtmB, acylneuraminate cytidylyltransferase  26.75 
 
 
235 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000281683  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2414  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.91 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.150981 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2210  pseudaminic acid CMP-transferase  25.11 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1161  CMP-Neu5Ac synthetase  27.52 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0150139  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3257  CMP-N-acetlyneuraminic acid synthetase  26.41 
 
 
232 aa  65.9  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1288  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.05 
 
 
232 aa  66.2  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02898  putative Acylneuraminate cytidylyltransferase  27.6 
 
 
234 aa  65.9  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00719916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1521  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.11 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563927  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2761  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  24.66 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.387843  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1506  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.45 
 
 
232 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.331299  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0406  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.09 
 
 
230 aa  65.1  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1972  acylneuraminate cytidylyltransferase, putative  27.22 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.338382  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.45 
 
 
232 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3990  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  22.91 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1578  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  26.64 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2627  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.91 
 
 
234 aa  64.3  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3009  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.43 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0656  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  27.23 
 
 
228 aa  63.2  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0382756  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3078  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.86 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3104  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  26.5 
 
 
233 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3562  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.58 
 
 
240 aa  62.8  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.298178 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2588  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  25.86 
 
 
233 aa  62.4  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.170529  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1520  posttranslational flagellin modification protein B  24.02 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3400  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.21 
 
 
248 aa  62.4  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0758  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.28 
 
 
233 aa  62  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3709  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  24.55 
 
 
241 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52779  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13063  putative NeuA  25.99 
 
 
230 aa  60.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1467  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  24.55 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165278  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1578  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.56 
 
 
230 aa  60.1  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202276  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0534  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.92 
 
 
234 aa  59.7  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0562  hypothetical protein  24.89 
 
 
226 aa  58.9  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0788  CMP-N-acetlyneuraminic acid synthetase  29.06 
 
 
232 aa  58.9  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0410  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.61 
 
 
238 aa  58.9  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1309  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.47 
 
 
238 aa  58.2  0.00000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.774986 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1536  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.03 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0817  CMP-N-acetlyneuraminic acid synthetase  28.63 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  24.07 
 
 
439 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0620  pseudaminic acid CMP-transferase  25 
 
 
240 aa  56.6  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0424075  hitchhiker  0.00180398 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2639  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  25.63 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3941  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.46 
 
 
237 aa  56.6  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0582629 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0378  posttranslational flagellin modification protein B  22.47 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0559  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.65 
 
 
229 aa  55.1  0.0000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3231  polysialic acid capsule biosynthesis N-acylneuraminate cytidylyltransferase NeuA  24.23 
 
 
418 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1844  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.75 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3365  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  24.57 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2397  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.65 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520098  normal  0.461762 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>