132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2838 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2838  acylneuraminate cytidylyltransferase  100 
 
 		 232 aa  482  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0478291  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1594  acylneuraminate cytidylyltransferase  46.82 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1883  acylneuraminate cytidylyltransferase  43.2 
 
 		 225 aa  160  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0054  acylneuraminate cytidylyltransferase  41.78 
 
 		 231 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0052  acylneuraminate cytidylyltransferase  40.64 
 
 		 231 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0163138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4769  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.81 
 
 		 224 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14211  hypothetical protein  41.35 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.409827  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  30.94 
 
 		 468 aa  107  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1790  acylneuraminate cytidylyltransferase, putative  28.63 
 
 		 231 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0169338 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1278  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  24.88 
 
 		 387 aa  88.6  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2247  demethylmenaquinone methyltransferase-like  27.27 
 
 		 439 aa  82.8  0.000000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.201422  normal  0.259439 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02898  putative Acylneuraminate cytidylyltransferase  24.9 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00719916  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1581  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.94 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1132  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.5 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36315  predicted protein  28.11 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.412907  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1387  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.27 
 
 		 241 aa  78.2  0.00000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.661123  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.22 
 
 		 548 aa  73.9  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1484  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.07 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.51038  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3094  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.57 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1514  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.74 
 
 		 233 aa  72  0.000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07300  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.5 
 
 		 227 aa  70.9  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0307  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.69 
 
 		 221 aa  69.3  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.245282  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0292  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.96 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1387  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.83 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00882869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0292  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  23.96 
 
 		 225 aa  68.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0559  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.08 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0656  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  23.11 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0382756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3030  pseudaminic acid CMP-transferase  22.67 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1024  acylneuraminate cytidylyltransferase  25.53 
 
 		 229 aa  66.6  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.261083 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00677  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  27.66 
 
 		 230 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2217  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  26.94 
 
 		 226 aa  64.7  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.454172  normal  0.965631 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3078  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.22 
 
 		 233 aa  64.7  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2324  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.11 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4941  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  27.48 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2761  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  23.32 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.387843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2627  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.43 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3941  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.65 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0582629 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2981  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  25.23 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0478934  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3125  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  25.23 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1320  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  25.42 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296134  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08741  hypothetical protein  23.11 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000149223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0052  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.16 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0975  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.72 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2210  pseudaminic acid CMP-transferase  22.87 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.63 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12871  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  26.91 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0341176 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1506  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.21 
 
 		 232 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.331299  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0562  hypothetical protein  22.57 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2094  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  21.37 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0817  CMP-N-acetlyneuraminic acid synthetase  25.66 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0788  CMP-N-acetlyneuraminic acid synthetase  25.66 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4264  pseudaminic acid CMP-transferase  23.42 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468178 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1309  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.55 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.774986 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2336  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  24.35 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.177119  normal  0.565326 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0009  putative transferase  22.41 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.848658  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0406  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.81 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2414  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.98 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150981 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0722  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  25.79 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  21.83 
 
 		 672 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0364  acylneuraminate cytidylyltransferase  25 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1288  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.97 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0148  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.35 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1158  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase NeuA  24.12 
 
 		 413 aa  53.9  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1844  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.4 
 
 		 254 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0087  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.43 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.770014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3550  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.43 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.271433 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001797  N-Acetylneuraminate cytidylyltransferase  23.66 
 
 		 230 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0634  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  24.64 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.684247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3709  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  21.72 
 
 		 241 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0534  acylneuraminate cytidylyltransferase  24.12 
 
 		 234 aa  52  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0462  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  23.18 
 
 		 230 aa  52  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1549  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.61 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3990  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  22.94 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1578  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.48 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13421  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  24.87 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3562  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.92 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.298178 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0021  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.22 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3009  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.11 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13063  putative NeuA  23.21 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2299  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  22.87 
 
 		 235 aa  49.7  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.941163  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0417  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.11 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1866  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  24.87 
 
 		 249 aa  49.7  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.805993 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2079  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  28.35 
 
 		 247 aa  48.5  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1728  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25.83 
 
 		 252 aa  48.5  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0599  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.91 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.233395  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3909  3-deoxy-D-manno-octulosonate cytidylyltransferase  26.83 
 
 		 428 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.790308 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2414  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  27.56 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02817  KpsU protein  24.56 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000715728  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1585  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.08 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02767  hypothetical protein  24.56 
 
 		 246 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000588459  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1521  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.67 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3222  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  24.56 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4089  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.74 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0844  acylneuraminate cytidylyltransferase  21.17 
 
 		 423 aa  46.6  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0507  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.4 
 
 		 240 aa  45.8  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2065  3-deoxy-manno-octulosonate cytidylyltransferase  25 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.211457 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1161  CMP-Neu5Ac synthetase  22.02 
 
 		 221 aa  45.4  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0150139  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0620  pseudaminic acid CMP-transferase  21.03 
 
 		 240 aa  45.4  0.0008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0424075  hitchhiker  0.00180398 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0758  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.5 
 
 		 233 aa  45.1  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1834  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.54 
 
 		 687 aa  45.1  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>