198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0620 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0620  pseudaminic acid CMP-transferase  100 
 
 		 240 aa  504  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0424075  hitchhiker  0.00180398 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3094  acylneuraminate cytidylyltransferase  48.42 
 
 		 226 aa  214  7e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.321644 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0656  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  45.7 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0382756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2324  acylneuraminate cytidylyltransferase  45.7 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.380587 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2210  pseudaminic acid CMP-transferase  44.2 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3078  acylneuraminate cytidylyltransferase  43.29 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3009  acylneuraminate cytidylyltransferase  43.11 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1309  acylneuraminate cytidylyltransferase  41.03 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.774986 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1288  acylneuraminate cytidylyltransferase  43.18 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2094  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  41.59 
 
 		 231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0857675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3709  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  42.29 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2414  acylneuraminate cytidylyltransferase  39.83 
 
 		 243 aa  183  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150981 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3030  pseudaminic acid CMP-transferase  44.14 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0087  acylneuraminate cytidylyltransferase  43.64 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.770014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3550  acylneuraminate cytidylyltransferase  43.64 
 
 		 236 aa  176  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0833068  normal  0.271433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1521  acylneuraminate cytidylyltransferase  42.04 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2761  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  42.53 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.387843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3562  acylneuraminate cytidylyltransferase  40.91 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.298178 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0562  hypothetical protein  40.27 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13063  putative NeuA  38.86 
 
 		 230 aa  166  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1549  acylneuraminate cytidylyltransferase  38.64 
 
 		 225 aa  164  9e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2627  acylneuraminate cytidylyltransferase  41.26 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0406  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.72 
 
 		 230 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02898  putative Acylneuraminate cytidylyltransferase  39.01 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00719916  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1328  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.28 
 
 		 232 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1506  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.84 
 
 		 232 aa  159  4e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.331299  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4264  pseudaminic acid CMP-transferase  40.81 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.468178 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2424  acylneuraminate cytidylyltransferase  37 
 
 		 235 aa  148  9e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.352723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3941  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.93 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0582629 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1320  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  34.08 
 
 		 231 aa  131  7.999999999999999e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000296134  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1387  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.27 
 
 		 229 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00882869 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1972  acylneuraminate cytidylyltransferase, putative  32.14 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.338382  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0148  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.52 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2639  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  30.63 
 
 		 230 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3125  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  31.7 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2981  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  31.7 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0478934  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0534  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.6 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0417  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.32 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00677  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  31.42 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2588  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  29.91 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.170529  hitchhiker  0.001297 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0634  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  29.86 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.684247  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0507  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.69 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4089  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.53 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0052  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 230 aa  99.8  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_0758  acylneuraminate cytidylyltransferase  50.59 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.527075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0410  acylneuraminate cytidylyltransferase  32.99 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001797  N-Acetylneuraminate cytidylyltransferase  28 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1585  acylneuraminate cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0307  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.53 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.245282  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1581  acylneuraminate cytidylyltransferase  43.64 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0817  CMP-N-acetlyneuraminic acid synthetase  32.75 
 
 		 232 aa  92.8  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0788  CMP-N-acetlyneuraminic acid synthetase  32.31 
 
 		 232 aa  91.3  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0443  acylneuraminate cytidylyltransferase  54.22 
 
 		 256 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0364  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.42 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1844  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.96 
 
 		 254 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_2336  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  28.44 
 
 		 232 aa  89.7  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.177119  normal  0.565326 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3400  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.27 
 
 		 248 aa  89.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1578  acylneuraminate cytidylyltransferase  33.77 
 
 		 230 aa  89.7  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.202276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3104  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  31.48 
 
 		 233 aa  88.2  9e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3257  CMP-N-acetlyneuraminic acid synthetase  30.81 
 
 		 232 aa  87.8  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13421  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  44.32 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.420993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1536  acylneuraminate cytidylyltransferase  27.6 
 
 		 231 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01151  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  31 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.438934 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0009  putative transferase  25.89 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.848658  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1578  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  27.91 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3012  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  46.07 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1229  flagellin modification protein PtmB, acylneuraminate cytidylyltransferase  29.02 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000281683  n/a   
 
 
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NC_013202  Hmuk_1467  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 239 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0021  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.29 
 
 		 233 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0292  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.85 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1161  CMP-Neu5Ac synthetase  24.55 
 
 		 221 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0150139  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3231  polysialic acid capsule biosynthesis N-acylneuraminate cytidylyltransferase NeuA  33.78 
 
 		 418 aa  80.5  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0292  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  31.85 
 
 		 225 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0599  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.8 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.233395  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4941  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  30.59 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.490996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3990  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  28.82 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4851  acylneuraminate cytidylyltransferase  29.15 
 
 		 238 aa  77  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.25473 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1158  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase NeuA  29.55 
 
 		 413 aa  75.9  0.0000000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2299  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  27.56 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.941163  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1132  acylneuraminate cytidylyltransferase  46.59 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3365  N-acylneuraminate cytidylyltransferase  28.82 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0559  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.16 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1455  acylneuraminate cytidylyltransferase  31.9 
 
 		 240 aa  73.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0706  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  42.22 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1514  acylneuraminate cytidylyltransferase  40.91 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0975  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.78 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0378  posttranslational flagellin modification protein B  27.56 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1520  posttranslational flagellin modification protein B  44.16 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1594  acylneuraminate cytidylyltransferase  22.69 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010803  Clim_1387  acylneuraminate cytidylyltransferase  37.76 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.661123  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_2397  acylneuraminate cytidylyltransferase  30.95 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.520098  normal  0.461762 
 
 
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NC_013204  Elen_1913  acylneuraminate cytidylyltransferase  26.61 
 
 		 548 aa  65.9  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000953718 
 
 
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NC_011060  Ppha_1484  acylneuraminate cytidylyltransferase  36.7 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.51038  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3318  Sialic acid synthase-like protein  25.47 
 
 		 672 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.785348  normal  0.206825 
 
 
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NC_007513  Syncc9902_0462  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  46.48 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0890039  n/a   
 
 
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NC_011726  PCC8801_0054  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.81 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013161  Cyan8802_0052  acylneuraminate cytidylyltransferase  23.81 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0163138  normal  1 
 
 
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NC_013757  Gobs_4332  acylneuraminate cytidylyltransferase  35.96 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1278  CMP-N-acetylneuraminic acid synthetase  25.74 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007516  Syncc9605_2217  putative acylneuraminate cytidylyltransferase  27.78 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.454172  normal  0.965631 
 
 
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