137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_R0031 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_R0031  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0074  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747725  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0011  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000691484  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0016  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0070  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0013  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480722  hitchhiker  0.0000885703 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna051  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000648525  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2722  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000264941  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00234  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0039  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0054  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0012  tRNA-Thr  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0123  tRNA-Thr  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000054481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0035  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000289059  normal  0.587643 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t101  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0032  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144022  normal  0.819537 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0037  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  0.113649 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0133  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000850923  normal  0.0129533 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0025  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000750128  normal  0.0484618 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0131  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000204709  normal  0.0765104 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0028  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.851168  unclonable  0.00000739307 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0013  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0113  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0429315  hitchhiker  0.00021617 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna090  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00922026  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0014  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.796812  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2070  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0024  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03611  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0018  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000105771  hitchhiker  0.00192537 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0022  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0029  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0004  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0145  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0524672  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07650  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0406963 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0004  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t064  tRNA-Thr  96.88 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0492871  hitchhiker  0.000000924528 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0028  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0032  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.387211 
 
 
-
 
NC_002950  PGt07  tRNA-Thr  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1361  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0013  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0035  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0047  tRNA-Thr  94.29 
 
 		 72 bp  54  0.000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00077  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000431752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0091  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.13219e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0061  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296073  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0003  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000292995  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0088  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00198921  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0012  tRNA-Thr  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0000000512028  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0081  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000871845  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tThr01  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 79 bp  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000642788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0015  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000141414  hitchhiker  0.00853262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0039  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.103551 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0061  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00680264  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0008  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000537274  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0008  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000148165  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4286  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.21666e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4720  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.2702999999999999e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5103  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000647348  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0014  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000357359  normal  0.0207901 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2802  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000503689  normal  0.100014 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0008  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000889632  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0047  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000841137  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0106  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000701517  hitchhiker  0.00222111 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4427  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000793255  hitchhiker  0.0000458064 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0029  tRNA-Thr  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.217954 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0020  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0034  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.952764  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4696  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.54682e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0054  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0389191  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4477  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.0000501815  hitchhiker  0.00000000000000791993 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4474  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000074305  hitchhiker  0.000220241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4355  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000300865  normal  0.983555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4387  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000102716  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4551  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000359327  hitchhiker  0.00000000000130381 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5444  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000119489  hitchhiker  0.00131782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00059  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0008  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0074  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0014  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000293663  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0075  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.192269  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0024  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0720012  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0006  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000680631  normal  0.388884 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0084  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.193841 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4207  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0107638  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4702  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00885482  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5073  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0168696  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0094  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.115915  hitchhiker  0.00356557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0631  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000484892  normal  0.0738312 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3568  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.607966  normal  0.920561 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4025  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3660  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3695  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0596681  normal  0.112328 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3589  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.236614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3588  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.25198  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3758  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4594  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.559283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0022  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000255037  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>