223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_R0039 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_R0061  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296073  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0034  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.952764  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0047  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000841137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0039  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.103551 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0032  tRNA-Thr  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.387211 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  0.113649 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0032  tRNA-Thr  96.23 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144022  normal  0.819537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0061  tRNA-Thr  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122342  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0010  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114274  hitchhiker  0.00000872087 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t04  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36184  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0005  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.63313  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4335  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0275  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000205711  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0007  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0037  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0388732 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0030  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0038  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70785  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0043  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.757841  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0056  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0066  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380799  normal  0.1543 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0057  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145876  hitchhiker  0.000000719754 
 
 
-
 
NC_003295  RS05587  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000149657  normal  0.0701364 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000416702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0012  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  4.11185e-23  normal  0.0771857 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0071  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0072869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0005  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0056  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0111608  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0069  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00993164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3795  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0022  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 72 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3085  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000338041  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0016  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236341  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0077  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000188112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0057  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0052  tRNA-Thr  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000639553  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0059  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579728  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0014  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116743  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0009  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238051  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0011  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137284  normal  0.0115711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0014  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000027785  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0013  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000000441208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0051  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0058  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0055  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.872606 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3187  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000488058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0027  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0070  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000211747  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0014  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000427945  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0061  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0048  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.623542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1905  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000000256586  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3763  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3825  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.366335  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3460  tRNA-Thr  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.0000610299  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0049  tRNA-Thr  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0008  tRNA-Thr  97.37 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000961846  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0013  tRNA-Thr  90.74 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0017  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0019  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0144795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60040  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.909692  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t07  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000225857  unclonable  0.000000193462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t008  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t07  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.222466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA67  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105718  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0045  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R87  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0031  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0975905  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0021  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0696816  normal  0.1141 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t004  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000811739  normal  0.123776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000237824  normal  0.0237533 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0084  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000286992  normal  0.992402 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0020  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0821  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0929777  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0057  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0074  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747725  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0016  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000937466  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0067  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.689375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0072  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.465958  hitchhiker  0.00803701 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0014  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000541259  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0124  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133621  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0015  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000257752  normal  0.024275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0015  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000756567  hitchhiker  0.00969138 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08670  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482106  hitchhiker  0.000524894 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0016  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0015  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294168  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0198  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0044  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000154669  normal  0.0727135 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0130  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000480729  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0046  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0468144  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA51  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0701295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0105  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288138  hitchhiker  0.0000019759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0048  tRNA-Thr  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000219709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0355  tRNA-Thr  100 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.337369  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0021  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0625627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0005  tRNA-Thr  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0026  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000120513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0004  tRNA-Thr  95 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>