276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_R0032 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0032  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.387211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0061  tRNA-Thr  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000296073  normal  0.403996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0039  tRNA-Thr  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.103551 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0034  tRNA-Thr  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.952764  normal  0.863091 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0047  tRNA-Thr  98.61 
 
 		 72 bp  135  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.000000841137  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0037  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  0.113649 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0032  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 75 bp  95.6  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000144022  normal  0.819537 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0061  tRNA-Thr  90.14 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0122342  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0004  tRNA-Thr  100 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0030  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t04  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.36184  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4335  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0275  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000205711  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0005  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.63313  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0038  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.70785  normal  0.208879 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0007  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0037  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0388732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0010  tRNA-Thr  96.08 
 
 		 76 bp  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000114274  hitchhiker  0.00000872087 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0043  tRNA-Thr  94 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.757841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0008  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000000961846  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0052  tRNA-Thr  91.94 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000639553  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0017  tRNA-Thr  96 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0031  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0975905  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0021  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0696816  normal  0.1141 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0020  tRNA-Thr  90.16 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0074  tRNA-Thr  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747725  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0019  tRNA-Thr  97.73 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0144795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t07  tRNA-Thr  97.73 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000225857  unclonable  0.000000193462 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t07  tRNA-Thr  97.73 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.222466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA67  tRNA-Thr  97.73 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105718  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0046  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0468144  normal  0.358768 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R87  tRNA-Thr  97.73 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0067  tRNA-Thr  97.73 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.689375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0016  tRNA-Thr  97.73 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000237824  normal  0.0237533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0057  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0013  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0369049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0049  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0072  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.465958  hitchhiker  0.00803701 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0084  tRNA-Thr  97.73 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000286992  normal  0.992402 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0021  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0625627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08670  tRNA-Thr  97.73 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482106  hitchhiker  0.000524894 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60040  tRNA-Thr  97.73 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.909692  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0821  tRNA-Thr  97.73 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0929777  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0044  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.000154669  normal  0.0727135 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0198  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0016  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0003  tRNA-Thr  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00291494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0052  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA51  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0701295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0105  tRNA-Thr  97.67 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000288138  hitchhiker  0.0000019759 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0005  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0045  tRNA-Thr  92.73 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0015  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146334  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0008  tRNA-Thr  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0026  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000120513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6021  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.893316 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0041  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0007  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.237633  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309355  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.824908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAThrVIMSS1309157  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0014  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0054  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0055  tRNA-Thr  95.12 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0070  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0632642 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAThrVIMSS1309354  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0028  tRNA-Thr  88.52 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309081  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAThrVIMSS1309082  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.248116  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAThrVIMSS1309113  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAThrVIMSS1309202  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.083443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAThrVIMSS1309299  tRNA-Thr  93.33 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0668617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0124  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0016  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000937466  hitchhiker  0.000524679 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t008  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t004  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000811739  normal  0.123776 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0056  tRNA-Thr  88.33 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0008  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000079978  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0355  tRNA-Thr  100 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.337369  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0130  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000480729  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000257752  normal  0.024275 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000756567  hitchhiker  0.00969138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294168  normal  0.0837368 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0014  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000541259  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0066  tRNA-Thr  88.33 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380799  normal  0.1543 
 
 
-
 
NC_003295  RS05587  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000149657  normal  0.0701364 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000416702  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0015  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000088003  normal  0.408699 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0069  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00993164  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3795  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128346  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0022  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000327134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3763  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152532  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0016  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236341  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0077  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000188112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0016  tRNA-Thr  90.2 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0057  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0014  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000427945  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0070  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000211747  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0014  tRNA-Thr  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116743  normal  0.141702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>