13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07650 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_07650  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0406963 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0015  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.123572  normal  0.0601938 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0016  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0074  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747725  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0058  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05958  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0031  tRNA-Thr  92.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0056  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00644368 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17550  tRNA-Thr  93.75 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.15703  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0004  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0004  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0028  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0032  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.387211 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0037  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  0.113649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>