32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_R0058 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_R0058  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05958  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0056  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00644368 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0081  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0015  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.123572  normal  0.0601938 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17550  tRNA-Thr  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.15703  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0057  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07650  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0406963 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_870  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000136902  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0062  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000811018  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0028  tRNA-Thr  92.86 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000277136  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0027  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.997139  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0027  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0020  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0148448 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0023  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0053  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0024  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.9344  normal  0.172928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0001  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00463461  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0002  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0189454  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0031  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0016  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0074  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747725  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0065  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337548 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0006  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000288516  hitchhiker  0.0000067546 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0048  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.397818  normal  0.996159 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0054  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0039  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0310  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0026  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0014  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000293663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0007  tRNA-Thr  86.21 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22668  hitchhiker  0.0000658151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0016  tRNA-Thr  89.13 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>