26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_R0015 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_R0015  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.123572  normal  0.0601938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07650  tRNA-Thr  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0406963 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17550  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.15703  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0058  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05958  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0056  tRNA-Thr  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00644368 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0016  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0074  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747725  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0057  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0080  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0207378  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0032  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.387211 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0028  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0031  tRNA-Thr  90 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0037  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  0.113649 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0004  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0004  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0049  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0004  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0061  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0029  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.707259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0027  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.557842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0055  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.872606 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0058  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0009  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0048  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000219709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0016  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236341  hitchhiker  0.00490505 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>