298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_R0009 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0049  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0173408  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0009  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.886976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0029  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.707259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0017  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000137246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0009  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000199446  normal  0.87079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0012  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000602687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0013  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0041  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0026  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0063  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0066  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0024  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.664304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0025  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.89126  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0028  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.500637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0028  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30863e-30 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0045  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.356708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0048  tRNA-Gly  90.28 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0042  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.177024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0012  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.46554  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0043  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0822724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0021  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0839387  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0043  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0285317  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0044  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0345012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0055  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138155  hitchhiker  0.00896758 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0002  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.385644 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna21  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna23  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0041  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142382  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.36527  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82132  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2253  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2245  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0921  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0053  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1978  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1545  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2331  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0152091  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0046  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000231748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0048  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000268025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0050  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000555856  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_R0005  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000151844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0030  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022612  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0031  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2165  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1650  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0241  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1730  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.873105  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1755  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0739  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.158339  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0891  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  88.89 
 
 		 777 bp  79.8  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.101452  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  92.73 
 
 		 72 bp  77.8  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495704  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS04003  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000136534  normal  0.315468 
 
 
-
 
NC_003295  RS04004  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000000202158  normal  0.305986 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0009  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0037  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.694382  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0011  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0189019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0034  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252828  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0006  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0032  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.165397  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0045  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0047  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.686497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0007  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.38046  normal  0.136228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0008  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.521069  normal  0.137143 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0010  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0183648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0037  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0670203 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0035  tRNA-Gly  94 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.724762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0035  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0007  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0030  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0039  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0036  tRNA-Gly  93.1 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0035  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0213758  normal  0.172215 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0028  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706726  normal  0.167752 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0016  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.867595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0025  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.404716  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0069  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.494624  hitchhiker  0.00109102 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0037  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0254902  normal  0.171485 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0017  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000592681  hitchhiker  0.00000010486 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0042  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443767  normal  0.830121 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1013  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0033  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0406258  normal  0.16961 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0909  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 78 bp  73.8  0.000000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0017  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0117925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0855  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.627024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0031  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0675454  normal  0.168417 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0006  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0028  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0030  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000189578  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0054  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0020  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1789  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212776  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0036  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0044  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.013329  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0045  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0960605  normal  0.982559 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0039  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00658177  decreased coverage  0.00000286482 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0040  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00614875  decreased coverage  0.00000263085 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>