83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_R0057 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_R0057  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0045  tRNA-Thr  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0775671  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0010  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0535352  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1871  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0184728  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0065  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00337548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0026  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0018  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000226987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0317  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000144022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0013  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0563085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0007  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.22668  hitchhiker  0.0000658151 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0025  tRNA-Thr  89.86 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.821281  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0034  tRNA-Thr  89.61 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.88486  normal  0.49295 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0016  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.35256e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0310  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0006  tRNA-Thr  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000288516  hitchhiker  0.0000067546 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0012  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000603563  normal  0.0893983 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08630  tRNA-Thr  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000480255  hitchhiker  0.000000163212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0014  tRNA-Thr  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000293663  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0017  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.79728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0020  tRNA-Thr  87.18 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000056123  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0048  tRNA-Thr  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.397818  normal  0.996159 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0055  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000011398  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00332161  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0028  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000277136  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0046  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000132851  normal  0.102838 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000811018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0055  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000633202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_870  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000136902  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0038  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.000000000920806  hitchhiker  0.00000030744 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09730  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.0000000907355  hitchhiker  0.0000119481 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0039  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0054  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000041401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0030  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0061  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00680264  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0035  tRNA-Thr  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0436953  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0025  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0058  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.05958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0043  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000011951  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0015  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000146334  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0062  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0028  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000383633  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt06  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt06  tRNA-Thr  84.72 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0056  tRNA-Thr  89.58 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00644368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0029  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.217954 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0028  tRNA-Thr  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000248442  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0081  tRNA-Thr  90.7 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0023  tRNA-Thr  86.67 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000013952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0003  tRNA-Thr  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000292995  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0013  tRNA-Thr  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0088  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000142546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26520  tRNA-Thr  93.94 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0015  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.123572  normal  0.0601938 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0042  tRNA-Thr  90.24 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0209686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t07  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.222466  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0084  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000286992  normal  0.992402 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0019  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0144795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0070  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0031  tRNA-Thr  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.401044  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0025  tRNA-Thr  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257059  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0016  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000237824  normal  0.0237533 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t07  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000225857  unclonable  0.000000193462 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0020  tRNA-Thr  86.54 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0021  tRNA-Thr  83.33 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0225545  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5648  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000502297  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0045  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000137446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA67  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105718  normal  0.63081 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0033  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60040  tRNA-Thr  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.909692  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0168  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00852327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5651  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000701056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0189  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000000579129  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Thr-5  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000184905  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000633532  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0034  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0821  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0929777  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0008  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00116073  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Thr-3  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000222462  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0067  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.689375  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08670  tRNA-Thr  86 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482106  hitchhiker  0.000524894 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000186681  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R87  tRNA-Thr  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000233692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>