250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8567 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8567  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  100 
 
 
462 aa  905    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.040779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2020  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  65.94 
 
 
458 aa  535  1e-151  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3843  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  63.28 
 
 
457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4084  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  59.4 
 
 
457 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4267  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.25 
 
 
464 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2241  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.57 
 
 
468 aa  428  1e-118  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3207  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50 
 
 
464 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.254389  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3106  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50 
 
 
464 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3007  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.56 
 
 
464 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3428  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.02 
 
 
467 aa  412  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10220  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  51.42 
 
 
462 aa  414  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.437932  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0662  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.02 
 
 
460 aa  414  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373641  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4703  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.17 
 
 
468 aa  412  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00565562  normal  0.677094 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1610  pyridine nucleotide transhydrogenase beta subunit  51.17 
 
 
470 aa  410  1e-113  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.181074  normal  0.230255 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1978  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  54.24 
 
 
470 aa  409  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3202  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.58 
 
 
475 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232806  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0680  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.35 
 
 
467 aa  408  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2170  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.69 
 
 
486 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2894  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.93 
 
 
475 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2973  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.02 
 
 
462 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.719312  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2181  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.42 
 
 
464 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2940  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.89 
 
 
468 aa  401  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1894  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.11 
 
 
452 aa  398  1e-109  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24532  hitchhiker  0.00603477 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0650  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.75 
 
 
460 aa  395  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0123191  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0937  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  47.36 
 
 
465 aa  385  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0907  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  46.83 
 
 
465 aa  385  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1317  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.61 
 
 
460 aa  382  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.474975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.34 
 
 
454 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722901 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6489  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.74 
 
 
464 aa  383  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2830  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.92 
 
 
466 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0895  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.65 
 
 
472 aa  380  1e-104  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479914  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1643  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.77 
 
 
459 aa  379  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.211392  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.89 
 
 
465 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4040  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.73 
 
 
468 aa  375  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  46.97 
 
 
465 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0270  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.74 
 
 
462 aa  377  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1718  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4185  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.93 
 
 
464 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283552  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2769  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.09 
 
 
492 aa  376  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0371  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  44.98 
 
 
470 aa  376  1e-103  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2120  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  41.85 
 
 
467 aa  375  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228007  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.07 
 
 
466 aa  375  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284684  normal  0.879821 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1652  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.26 
 
 
471 aa  372  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000557684  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000127  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  42.08 
 
 
458 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129759  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1532  NAD(P) transhydrogenase, subunit beta  47.14 
 
 
457 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00326039  normal  0.0132838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3654  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.35 
 
 
461 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2804  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.87 
 
 
465 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982075  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3366  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.61 
 
 
464 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1499  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.03 
 
 
456 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0772832  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3124  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.03 
 
 
456 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.43 
 
 
470 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3540  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.4 
 
 
465 aa  370  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261084  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3668  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.49 
 
 
464 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182958  normal  0.472928 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0971  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.14 
 
 
466 aa  367  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.97 
 
 
469 aa  365  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2079  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.2 
 
 
457 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153868  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2295  pyridine nucleotide transhydrogenase  42.64 
 
 
464 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2274  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.75 
 
 
464 aa  366  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0795345  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4747  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.62 
 
 
477 aa  368  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4537  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.96 
 
 
502 aa  366  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0249  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.74 
 
 
462 aa  365  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000325703  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2988  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.06 
 
 
466 aa  368  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1845  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.68 
 
 
470 aa  365  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0749679  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3849  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.87 
 
 
466 aa  367  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0911  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.14 
 
 
466 aa  367  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4578  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.45 
 
 
471 aa  365  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  0.4459 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05734  pyridine nucleotide transhydrogenase  41.76 
 
 
464 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1831  pyridine nucleotide transhydrogenase  42.64 
 
 
464 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1942  pyridine nucleotide transhydrogenase  42.64 
 
 
464 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.530716  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.97 
 
 
467 aa  365  1e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0565  pyridine nucleotide transhydrogenase  42.92 
 
 
458 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0498  pyridine nucleotide transhydrogenase  42.03 
 
 
458 aa  364  2e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000166801  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0589  NAD/NADP transhydrogenase subunit beta  46.7 
 
 
474 aa  363  3e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.858415  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10158  NAD(P) transhydrogenase beta subunit pntB  47.74 
 
 
475 aa  362  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.28 
 
 
467 aa  362  8e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01571  pyridine nucleotide transhydrogenase  42.46 
 
 
462 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  42.46 
 
 
462 aa  360  2e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2028  pyridine nucleotide transhydrogenase  42.46 
 
 
462 aa  360  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1809  pyridine nucleotide transhydrogenase  42.46 
 
 
462 aa  360  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.391181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1788  pyridine nucleotide transhydrogenase  42.46 
 
 
462 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  40.68 
 
 
482 aa  361  2e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2312  pyridine nucleotide transhydrogenase  42.46 
 
 
462 aa  360  2e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1597  pyridine nucleotide transhydrogenase  42.46 
 
 
462 aa  360  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.240547  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3082  pyridine nucleotide transhydrogenase  41.73 
 
 
494 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.167406  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0890  pyridine nucleotide transhydrogenase  41.73 
 
 
494 aa  361  2e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0967297  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01561  hypothetical protein  42.46 
 
 
462 aa  360  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0853  pyridine nucleotide transhydrogenase  41.73 
 
 
494 aa  361  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1676  pyridine nucleotide transhydrogenase  42.46 
 
 
462 aa  360  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.544393  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2841  pyridine nucleotide transhydrogenase  41.16 
 
 
494 aa  361  2e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3066  pyridine nucleotide transhydrogenase  41.33 
 
 
494 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00270245  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2107  pyridine nucleotide transhydrogenase  42.89 
 
 
462 aa  360  4e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2948  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.57 
 
 
473 aa  359  5e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.703596  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.71 
 
 
472 aa  359  5e-98  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3753  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.37 
 
 
471 aa  359  7e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.423097  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1181  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.08 
 
 
472 aa  358  9e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2584  pyridine nucleotide transhydrogenase  42 
 
 
464 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1386  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.7 
 
 
466 aa  358  9.999999999999999e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.239557  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1381  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.11 
 
 
493 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.72978  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2060  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.12 
 
 
468 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000258275 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0958  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.86 
 
 
472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368663  hitchhiker  0.000000193874 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6409  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.07 
 
 
491 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>