250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2940 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2940  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  100 
 
 
468 aa  913    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4703  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50.64 
 
 
468 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00565562  normal  0.677094 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3202  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.64 
 
 
475 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232806  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2894  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.64 
 
 
475 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1978  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  55.65 
 
 
470 aa  415  1e-114  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3428  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.07 
 
 
467 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0662  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.93 
 
 
460 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373641  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4267  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.57 
 
 
464 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2241  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.71 
 
 
468 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0650  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.36 
 
 
460 aa  396  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0123191  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0680  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.46 
 
 
467 aa  395  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2170  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.44 
 
 
486 aa  384  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10220  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  48.63 
 
 
462 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.437932  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8567  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.43 
 
 
462 aa  374  1e-102  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.149953  normal  0.040779 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6489  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.96 
 
 
464 aa  372  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1610  pyridine nucleotide transhydrogenase beta subunit  47.11 
 
 
470 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.181074  normal  0.230255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4040  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.66 
 
 
468 aa  368  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2020  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.97 
 
 
458 aa  363  2e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3106  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.34 
 
 
464 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1908  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.13 
 
 
519 aa  363  4e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2973  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.55 
 
 
462 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.719312  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3207  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.26 
 
 
464 aa  362  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.254389  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3007  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.12 
 
 
464 aa  360  4e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.11 
 
 
470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0371  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  44.4 
 
 
470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0367  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.71 
 
 
465 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.541099  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3366  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.68 
 
 
464 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.47 
 
 
465 aa  355  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.42 
 
 
467 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2804  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.11 
 
 
465 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982075  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0557  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.41 
 
 
466 aa  354  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0972119  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0545  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.66 
 
 
466 aa  352  5e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0907  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  44.61 
 
 
465 aa  352  8e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0565  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.35 
 
 
458 aa  352  8e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1799  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.28 
 
 
455 aa  351  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.287028  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2769  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.29 
 
 
492 aa  352  1e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3654  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.54 
 
 
461 aa  351  2e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0233  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.61 
 
 
486 aa  351  2e-95  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.448923  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1516  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.19 
 
 
455 aa  351  2e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15909  normal  0.640123 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0624  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.1 
 
 
458 aa  351  2e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2181  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.34 
 
 
464 aa  350  3e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4185  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.04 
 
 
464 aa  350  3e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283552  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4578  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.78 
 
 
471 aa  350  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  0.4459 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1499  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.62 
 
 
456 aa  350  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0772832  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3124  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.62 
 
 
456 aa  350  4e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3668  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.63 
 
 
464 aa  350  4e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182958  normal  0.472928 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2005  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.82 
 
 
481 aa  350  4e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2562  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.67 
 
 
486 aa  349  5e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0634  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  42.58 
 
 
470 aa  349  5e-95  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.282238  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0937  NAD(P) transhydrogenase subunit beta (pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta)  44.19 
 
 
465 aa  348  9e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  44.19 
 
 
465 aa  348  2e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5779  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.53 
 
 
470 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496694  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03896  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  44.69 
 
 
449 aa  347  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1845  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  42.64 
 
 
470 aa  347  3e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0749679  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2120  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  41.36 
 
 
467 aa  346  4e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228007  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.31 
 
 
469 aa  346  6e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.04 
 
 
454 aa  345  7e-94  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00722901 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4747  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.58 
 
 
477 aa  345  7e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3966  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.82 
 
 
466 aa  346  7e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155526  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0895  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.22 
 
 
472 aa  345  8e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479914  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1894  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.44 
 
 
452 aa  345  8.999999999999999e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.24532  hitchhiker  0.00603477 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.05 
 
 
482 aa  345  1e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01571  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.38 
 
 
462 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.38 
 
 
462 aa  344  2e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01561  hypothetical protein  43.38 
 
 
462 aa  344  2e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1676  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.38 
 
 
462 aa  344  2e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.544393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1809  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.38 
 
 
462 aa  344  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.391181  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2028  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.38 
 
 
462 aa  344  2e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2312  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.38 
 
 
462 aa  344  2e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1788  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.38 
 
 
462 aa  344  2e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850181  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1397  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  42.74 
 
 
481 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0958  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.64 
 
 
472 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368663  hitchhiker  0.000000193874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1532  NAD(P) transhydrogenase, subunit beta  47.52 
 
 
457 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00326039  normal  0.0132838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1276  response regulator receiver domain-containing protein  43.65 
 
 
491 aa  343  4e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000183659  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1597  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.16 
 
 
462 aa  343  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.240547  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2948  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.82 
 
 
473 aa  343  5e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.703596  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1153  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  42.86 
 
 
459 aa  342  5.999999999999999e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0634538  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0589  NAD/NADP transhydrogenase subunit beta  43.4 
 
 
474 aa  342  5.999999999999999e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.858415  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5543  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.55 
 
 
470 aa  342  7e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1317  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.04 
 
 
460 aa  342  8e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.474975 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0997  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  43.59 
 
 
465 aa  342  8e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10158  NAD(P) transhydrogenase beta subunit pntB  49.57 
 
 
475 aa  342  1e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3350  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.09 
 
 
484 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2295  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.44 
 
 
464 aa  340  2e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2972  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.67 
 
 
486 aa  341  2e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2830  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.34 
 
 
466 aa  340  2e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1942  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.44 
 
 
464 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.530716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3384  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.09 
 
 
484 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1831  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.44 
 
 
464 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1437  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.28 
 
 
467 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2368  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.09 
 
 
484 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1144  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.09 
 
 
484 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0128305  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2548  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.09 
 
 
484 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0282  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.09 
 
 
484 aa  340  4e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4666  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.67 
 
 
465 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2965  NAD(P) transhydrogenase, subunit beta  43.88 
 
 
490 aa  339  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1652  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  42.77 
 
 
471 aa  339  5e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000557684  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0498  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.02 
 
 
458 aa  339  8e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000166801  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0277  pyridine nucleotide transhydrogenase subunit beta  44.67 
 
 
478 aa  338  9e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  42.69 
 
 
484 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>