251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4537 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4747  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  73.31 
 
 
477 aa  658    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.239921  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4537  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  100 
 
 
502 aa  986    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10158  NAD(P) transhydrogenase beta subunit pntB  69.47 
 
 
475 aa  570  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10220  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  61.09 
 
 
462 aa  530  1e-149  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.437932  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0662  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50.1 
 
 
460 aa  424  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373641  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6489  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.31 
 
 
464 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4703  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.52 
 
 
468 aa  413  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00565562  normal  0.677094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2973  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.94 
 
 
462 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.719312  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0680  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.97 
 
 
467 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4267  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.03 
 
 
464 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3428  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.65 
 
 
467 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2241  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.33 
 
 
468 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2894  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.08 
 
 
475 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3007  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.17 
 
 
464 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0650  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.85 
 
 
460 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0123191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3202  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.28 
 
 
475 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232806  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3207  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.28 
 
 
464 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.254389  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2769  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.96 
 
 
492 aa  397  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3106  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.28 
 
 
464 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2170  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.39 
 
 
486 aa  395  1e-108  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0895  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.35 
 
 
472 aa  389  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.479914  normal  0.207248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6856  pyridine nucleotide transhydrogenase (proton pump), beta subunit  47.92 
 
 
465 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1610  pyridine nucleotide transhydrogenase beta subunit  48.24 
 
 
470 aa  389  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.181074  normal  0.230255 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2988  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.79 
 
 
466 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2020  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.47 
 
 
458 aa  386  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.13 
 
 
470 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2181  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.62 
 
 
464 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0270  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.38 
 
 
462 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1718  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4040  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.18 
 
 
468 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4006  putative NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.17 
 
 
484 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.161511  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4185  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.34 
 
 
464 aa  379  1e-104  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283552  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0371  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  46.54 
 
 
470 aa  379  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1908  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.22 
 
 
519 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1978  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.49 
 
 
470 aa  378  1e-103  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.184754  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5018  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.11 
 
 
484 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1499  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.41 
 
 
456 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0772832  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3124  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.41 
 
 
456 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3366  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.71 
 
 
464 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1242  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  45.53 
 
 
479 aa  376  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3654  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.95 
 
 
461 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3540  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.81 
 
 
465 aa  375  1e-103  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261084  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5464  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.11 
 
 
484 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2274  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.65 
 
 
464 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0795345  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1276  response regulator receiver domain-containing protein  43.85 
 
 
491 aa  373  1e-102  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000183659  normal  0.277241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3849  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.52 
 
 
466 aa  373  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3668  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.87 
 
 
464 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182958  normal  0.472928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2804  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.29 
 
 
465 aa  374  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982075  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2060  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.01 
 
 
468 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000258275 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6364  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.88 
 
 
488 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5290  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.88 
 
 
488 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5722  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.6 
 
 
489 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330559  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0249  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.23 
 
 
462 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  unclonable  0.000000325703  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0958  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.65 
 
 
472 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368663  hitchhiker  0.000000193874 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2562  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.01 
 
 
486 aa  371  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2549  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.11 
 
 
467 aa  370  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.859449  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13101  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  45.65 
 
 
478 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.608355  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03896  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  44.92 
 
 
449 aa  367  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.52 
 
 
465 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0971  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.71 
 
 
466 aa  368  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0911  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.71 
 
 
466 aa  368  1e-100  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12191  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  43.94 
 
 
477 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.48318 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3253  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.39 
 
 
467 aa  368  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.680585 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6042  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.24 
 
 
475 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0112  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.63 
 
 
477 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0693  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  43.97 
 
 
484 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645148  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0207  NAD(P) transhydrogenase beta subunit  48.65 
 
 
465 aa  368  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.251626  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4578  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.69 
 
 
471 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  0.4459 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2541  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.7 
 
 
483 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.6 
 
 
467 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1652  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.14 
 
 
471 aa  366  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000557684  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0367  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.29 
 
 
465 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.541099  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2761  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.48 
 
 
466 aa  365  1e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2972  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.17 
 
 
486 aa  365  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2295  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.31 
 
 
464 aa  364  2e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0545  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.61 
 
 
466 aa  364  2e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1831  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.31 
 
 
464 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1942  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.31 
 
 
464 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.530716  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2948  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.48 
 
 
473 aa  363  3e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.703596  normal  0.15563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5072  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.72 
 
 
476 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235878  hitchhiker  0.00886969 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1381  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.01 
 
 
493 aa  363  3e-99  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.72978  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1968  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.56 
 
 
482 aa  364  3e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.41 
 
 
469 aa  363  4e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.24 
 
 
482 aa  363  4e-99  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0669  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.17 
 
 
484 aa  363  4e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.903362  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0393  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.18 
 
 
475 aa  362  7.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.12 
 
 
467 aa  362  8e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2368  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.76 
 
 
484 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2548  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.76 
 
 
484 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1144  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.76 
 
 
484 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0128305  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0282  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.76 
 
 
484 aa  362  9e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.51 
 
 
478 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000848763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0173  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  44.51 
 
 
478 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.69826  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0218  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.97 
 
 
484 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.496712  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0425  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.6 
 
 
474 aa  362  1e-98  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0702  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.97 
 
 
484 aa  362  1e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.086333  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4433  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.08 
 
 
478 aa  362  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.605009 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0557  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.86 
 
 
466 aa  360  2e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0972119  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3392  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  43.76 
 
 
607 aa  360  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3350  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.76 
 
 
484 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3384  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  43.76 
 
 
484 aa  361  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>