250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03896 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_03896  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  100 
 
 
449 aa  906    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3654  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  61.5 
 
 
461 aa  557  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0662  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  53.52 
 
 
460 aa  464  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.373641  hitchhiker  0.00135879 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4578  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  54.53 
 
 
471 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.579726  normal  0.4459 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0650  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.76 
 
 
460 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0123191  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2170  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  51.9 
 
 
486 aa  425  1e-118  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3428  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51.21 
 
 
467 aa  426  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4703  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  50.44 
 
 
468 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00565562  normal  0.677094 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0680  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.78 
 
 
467 aa  422  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2894  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.45 
 
 
475 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2241  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.45 
 
 
468 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4267  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  50.88 
 
 
464 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4040  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  51 
 
 
468 aa  416  9.999999999999999e-116  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3202  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.67 
 
 
475 aa  416  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.232806  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2973  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  49.45 
 
 
462 aa  411  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.719312  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2767  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.22 
 
 
465 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3106  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.1 
 
 
464 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7227  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.02 
 
 
470 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.346916  normal  0.136469 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3007  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.55 
 
 
464 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3207  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48 
 
 
464 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.254389  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0367  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  49.45 
 
 
465 aa  400  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.541099  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0261  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.69 
 
 
482 aa  392  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5779  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  47.36 
 
 
470 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496694  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1652  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.27 
 
 
471 aa  385  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000557684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0425  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.71 
 
 
474 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6489  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.32 
 
 
464 aa  385  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2965  NAD(P) transhydrogenase, subunit beta  48.12 
 
 
490 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4185  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.9 
 
 
464 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.283552  normal  0.426048 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2562  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.39 
 
 
486 aa  384  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.356594 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1516  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.12 
 
 
455 aa  378  1e-104  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.15909  normal  0.640123 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6364  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.72 
 
 
488 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.275177  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4666  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.12 
 
 
465 aa  378  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5290  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.72 
 
 
488 aa  382  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5722  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.72 
 
 
489 aa  381  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.330559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2830  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.69 
 
 
466 aa  379  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0233716 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2181  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.01 
 
 
464 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10220  NAD/NADP transhydrogenase beta subunit  47.16 
 
 
462 aa  380  1e-104  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.437932  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2804  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.31 
 
 
465 aa  379  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.982075  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2769  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.89 
 
 
492 aa  379  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5543  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.14 
 
 
470 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.362184  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3366  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.53 
 
 
464 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1757  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.14 
 
 
466 aa  377  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.284684  normal  0.879821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3741  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.45 
 
 
469 aa  378  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1799  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.12 
 
 
455 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.287028  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0557  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.74 
 
 
466 aa  375  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0972119  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2155  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.38 
 
 
472 aa  378  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1397  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.43 
 
 
481 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2972  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.71 
 
 
486 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1610  pyridine nucleotide transhydrogenase beta subunit  49.12 
 
 
470 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.181074  normal  0.230255 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0624  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.09 
 
 
458 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.557711  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0545  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.53 
 
 
466 aa  376  1e-103  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0832209 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2278  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  47.05 
 
 
466 aa  378  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.314392 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1942  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.47 
 
 
464 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.530716  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1831  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.47 
 
 
464 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1908  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.82 
 
 
519 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2295  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.47 
 
 
464 aa  378  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.790877  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0565  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.44 
 
 
458 aa  376  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0634  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.64 
 
 
470 aa  378  1e-103  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.282238  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01571  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.36 
 
 
462 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2041  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  46.36 
 
 
462 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.181904  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2733  transmembrane NADP transhydrogenase subunit beta oxidoreductase protein  47.18 
 
 
486 aa  373  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2312  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.36 
 
 
462 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000127  NAD(P) transhydrogenase subunit beta  45.29 
 
 
458 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129759  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1788  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.36 
 
 
462 aa  374  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.850181  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1597  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.36 
 
 
462 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.240547  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1845  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  48.11 
 
 
470 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0749679  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1676  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.36 
 
 
462 aa  374  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.544393  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1809  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.36 
 
 
462 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.391181  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0930  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.62 
 
 
494 aa  373  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.339922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01561  hypothetical protein  46.36 
 
 
462 aa  374  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3195  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.07 
 
 
494 aa  372  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2028  pyridine nucleotide transhydrogenase  46.36 
 
 
462 aa  374  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.870714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2120  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.66 
 
 
467 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00228007  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2841  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.54 
 
 
494 aa  373  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3668  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.8 
 
 
464 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182958  normal  0.472928 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1850  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.05 
 
 
462 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.513378  normal  0.520422 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0498  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.78 
 
 
458 aa  370  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000166801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0112  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.26 
 
 
477 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1242  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  45.22 
 
 
479 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4660  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.37 
 
 
467 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3753  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.61 
 
 
471 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.423097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0958  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.48 
 
 
472 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000368663  hitchhiker  0.000000193874 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3966  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.37 
 
 
466 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.155526  normal  0.614792 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2541  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.53 
 
 
483 aa  370  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2079  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.43 
 
 
457 aa  371  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153868  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0233  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.97 
 
 
486 aa  369  1e-101  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.448923  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3082  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.33 
 
 
494 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.167406  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0890  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.33 
 
 
494 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0967297  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6042  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  48.5 
 
 
475 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0853  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.33 
 
 
494 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1784  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.45 
 
 
469 aa  365  1e-100  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4261  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.13 
 
 
487 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3066  pyridine nucleotide transhydrogenase  43.57 
 
 
494 aa  368  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00270245  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6058  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  46.64 
 
 
489 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6409  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  45.77 
 
 
491 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.243457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3540  NAD(P)(+) transhydrogenase (AB-specific)  45.57 
 
 
465 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.261084  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05734  pyridine nucleotide transhydrogenase  44.25 
 
 
464 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1229  NAD(P) transhydrogenase, beta subunit  44.85 
 
 
466 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.47305  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2107  pyridine nucleotide transhydrogenase  45.43 
 
 
462 aa  367  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.326221  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12191  putative nicotinamide nucleotide transhydrogenase, subunit beta  46.94 
 
 
477 aa  366  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.48318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>