29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5930 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5930  hypothetical protein  100 
 
 		 242 aa  477  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0670577 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30680  hypothetical protein  41.67 
 
 		 274 aa  155  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3972  hypothetical protein  39.15 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4046  hypothetical protein  39.15 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4476  hypothetical protein  37.39 
 
 		 247 aa  136  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0213955  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3986  hypothetical protein  39.15 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132001  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2840  hypothetical protein  38.32 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.441542  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1985  hypothetical protein  38.1 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0540  hypothetical protein  38.57 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0802  hypothetical protein  40.3 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1885  hypothetical protein  43.9 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0783  hypothetical protein  35.21 
 
 		 291 aa  122  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2856  hypothetical protein  41.38 
 
 		 262 aa  121  9.999999999999999e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2219  hypothetical protein  38.26 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0312  hypothetical protein  36.99 
 
 		 288 aa  116  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11275  hypothetical protein  33.96 
 
 		 262 aa  111  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0967945 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12750  hypothetical protein  31.34 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1212  hypothetical protein  35.11 
 
 		 251 aa  94  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0125049  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4117  hypothetical protein  26.9 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01700  hypothetical protein  35.27 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2914  hypothetical protein  26.5 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4621  hypothetical protein  25 
 
 		 226 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  decreased coverage  0.0000000039388 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1117  hypothetical protein  28.48 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.616893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3918  hypothetical protein  27.33 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1452  hypothetical protein  29.29 
 
 		 269 aa  48.9  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0113  hypothetical protein  27.74 
 
 		 244 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0842  hypothetical protein  26.05 
 
 		 220 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9665e-36 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1861  hypothetical protein  26.11 
 
 		 215 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1528  hypothetical protein  28.36 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>