17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1452 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1452  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  527  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3918  hypothetical protein  41.5 
 
 		 215 aa  166  5e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0113  hypothetical protein  40.54 
 
 		 244 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6024  hypothetical protein  42.2 
 
 		 243 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0842  hypothetical protein  39.01 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9665e-36 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1694  hypothetical protein  39.52 
 
 		 288 aa  136  4e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1861  hypothetical protein  38.42 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1528  hypothetical protein  40.12 
 
 		 222 aa  130  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813694 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1869  hypothetical protein  37.44 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000122959  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16720  hypothetical protein  40.1 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.923744  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1263  hypothetical protein  30.45 
 
 		 214 aa  106  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0102895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0153  hypothetical protein  33.85 
 
 		 234 aa  102  6e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.161082  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17150  hypothetical protein  32.29 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059036  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1117  hypothetical protein  31.06 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.616893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5930  hypothetical protein  29.89 
 
 		 242 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0670577 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0802  hypothetical protein  30.56 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0529  hypothetical protein  28.77 
 
 		 261 aa  43.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>