18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0113 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0113  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1861  hypothetical protein  57.35 
 
 		 215 aa  260  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0842  hypothetical protein  54.73 
 
 		 220 aa  241  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9665e-36 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1869  hypothetical protein  49.76 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000122959  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3918  hypothetical protein  44.5 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1452  hypothetical protein  40.41 
 
 		 269 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6024  hypothetical protein  44.81 
 
 		 243 aa  122  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1528  hypothetical protein  35.22 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00813694 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16720  hypothetical protein  39.42 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.923744  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1694  hypothetical protein  30.3 
 
 		 288 aa  101  9e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1263  hypothetical protein  35.06 
 
 		 214 aa  95.9  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0102895  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17150  hypothetical protein  34.48 
 
 		 237 aa  93.6  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059036  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0153  hypothetical protein  30.67 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.161082  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1117  hypothetical protein  34.85 
 
 		 220 aa  79.7  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.616893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0635  hypothetical protein  31.21 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0529  hypothetical protein  25.15 
 
 		 261 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2086  hypothetical protein  24.39 
 
 		 260 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2425  LasA  25.29 
 
 		 290 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930714  normal  0.104179 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>