17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3918 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3918  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  424  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0113  hypothetical protein  44.5 
 
 
244 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0842  hypothetical protein  46.46 
 
 
220 aa  185  4e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9665e-36 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1861  hypothetical protein  40.98 
 
 
215 aa  167  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6024  hypothetical protein  40.65 
 
 
243 aa  144  9e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1452  hypothetical protein  44.16 
 
 
269 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1869  hypothetical protein  43.88 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000122959  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1528  hypothetical protein  35 
 
 
222 aa  112  5e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00813694 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16720  hypothetical protein  36.08 
 
 
235 aa  99.4  4e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.923744  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1263  hypothetical protein  32.38 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0102895  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1694  hypothetical protein  30.23 
 
 
288 aa  85.9  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1117  hypothetical protein  33.33 
 
 
220 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.616893  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0153  hypothetical protein  30.32 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.161082  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17150  hypothetical protein  28.67 
 
 
237 aa  72  0.000000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0529  hypothetical protein  25.79 
 
 
261 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2086  hypothetical protein  24.84 
 
 
260 aa  48.5  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0802  hypothetical protein  30.09 
 
 
222 aa  41.2  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>