18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_1861 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_1861  hypothetical protein  100 
 
 
215 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0113  hypothetical protein  57.35 
 
 
244 aa  260  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0842  hypothetical protein  58.29 
 
 
220 aa  244  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9665e-36 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1869  hypothetical protein  43.96 
 
 
244 aa  174  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000122959  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3918  hypothetical protein  40.98 
 
 
215 aa  167  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1694  hypothetical protein  32.75 
 
 
288 aa  111  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6024  hypothetical protein  36.16 
 
 
243 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1452  hypothetical protein  38.41 
 
 
269 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1528  hypothetical protein  37.84 
 
 
222 aa  101  8e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00813694 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1263  hypothetical protein  35.95 
 
 
214 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0102895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16720  hypothetical protein  36.9 
 
 
235 aa  95.5  6e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.923744  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17150  hypothetical protein  32.87 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059036  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0153  hypothetical protein  27.81 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.161082  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1117  hypothetical protein  30.32 
 
 
220 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.616893  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2425  LasA  25.71 
 
 
290 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930714  normal  0.104179 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0529  hypothetical protein  26.79 
 
 
261 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2086  hypothetical protein  25.58 
 
 
260 aa  48.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353027  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0635  hypothetical protein  27.22 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>