19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1869 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1869  hypothetical protein  100 
 
 
244 aa  480  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000122959  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0113  hypothetical protein  49.76 
 
 
244 aa  209  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0842  hypothetical protein  50.25 
 
 
220 aa  205  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9665e-36 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1861  hypothetical protein  43.96 
 
 
215 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0736957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3918  hypothetical protein  42.03 
 
 
215 aa  155  6e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6024  hypothetical protein  39.89 
 
 
243 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1694  hypothetical protein  33.33 
 
 
288 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1452  hypothetical protein  37.44 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1528  hypothetical protein  41.22 
 
 
222 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00813694 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1263  hypothetical protein  30.95 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0102895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16720  hypothetical protein  39.02 
 
 
235 aa  91.3  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.923744  normal  0.426223 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17150  hypothetical protein  35.66 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059036  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1117  hypothetical protein  33.83 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.616893  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0153  hypothetical protein  32.41 
 
 
234 aa  69.3  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.161082  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2086  hypothetical protein  26 
 
 
260 aa  46.2  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2287  putative protease  27.31 
 
 
281 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.12246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5930  hypothetical protein  29.7 
 
 
242 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0670577 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1676  hypothetical protein  22.91 
 
 
217 aa  42.7  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.662344  normal  0.751432 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0529  hypothetical protein  23.87 
 
 
261 aa  42  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>