22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3972 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3972  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4046  hypothetical protein  100 
 
 
252 aa  496  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3986  hypothetical protein  99.21 
 
 
252 aa  493  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132001  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4476  hypothetical protein  76.4 
 
 
247 aa  348  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0213955  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2219  hypothetical protein  74.49 
 
 
247 aa  312  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11275  hypothetical protein  62.45 
 
 
262 aa  261  4.999999999999999e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0967945 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1885  hypothetical protein  49.52 
 
 
243 aa  157  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1212  hypothetical protein  46.48 
 
 
251 aa  157  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0125049  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30680  hypothetical protein  39.49 
 
 
274 aa  138  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0540  hypothetical protein  37 
 
 
268 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5930  hypothetical protein  39.15 
 
 
242 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0670577 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0783  hypothetical protein  35.24 
 
 
291 aa  112  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2840  hypothetical protein  38.5 
 
 
237 aa  112  6e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.441542  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0312  hypothetical protein  38.84 
 
 
288 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1985  hypothetical protein  34.09 
 
 
249 aa  108  1e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2856  hypothetical protein  39.05 
 
 
262 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12750  hypothetical protein  33 
 
 
250 aa  98.6  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01700  hypothetical protein  35.34 
 
 
289 aa  84.3  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0802  hypothetical protein  34.31 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17150  hypothetical protein  37.4 
 
 
237 aa  48.9  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059036  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4117  hypothetical protein  24.07 
 
 
254 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4621  hypothetical protein  25.89 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  decreased coverage  0.0000000039388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>