21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30680 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_30680  hypothetical protein  100 
 
 		 274 aa  540  1e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2840  hypothetical protein  57.62 
 
 		 237 aa  219  3e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.441542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0783  hypothetical protein  54.46 
 
 		 291 aa  202  6e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1985  hypothetical protein  53.59 
 
 		 249 aa  201  7e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2856  hypothetical protein  52.34 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4476  hypothetical protein  42.05 
 
 		 247 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0213955  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3972  hypothetical protein  39.49 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4046  hypothetical protein  39.49 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3986  hypothetical protein  39.49 
 
 		 252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132001  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5930  hypothetical protein  41.67 
 
 		 242 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0670577 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1885  hypothetical protein  43.14 
 
 		 243 aa  129  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2219  hypothetical protein  42.56 
 
 		 247 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0540  hypothetical protein  34.11 
 
 		 268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1212  hypothetical protein  38.28 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0125049  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12750  hypothetical protein  32.99 
 
 		 250 aa  105  7e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11275  hypothetical protein  36.27 
 
 		 262 aa  102  5e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0967945 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0312  hypothetical protein  32.71 
 
 		 288 aa  99.4  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0802  hypothetical protein  33 
 
 		 222 aa  89  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01700  hypothetical protein  32.05 
 
 		 289 aa  81.3  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2914  hypothetical protein  23.5 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4621  hypothetical protein  24.73 
 
 		 226 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  decreased coverage  0.0000000039388 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>