23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1885 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1885  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  477  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1212  hypothetical protein  55.65 
 
 
251 aa  186  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0125049  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4046  hypothetical protein  48.83 
 
 
252 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3986  hypothetical protein  48.83 
 
 
252 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132001  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3972  hypothetical protein  48.83 
 
 
252 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4476  hypothetical protein  46.26 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0213955  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2219  hypothetical protein  46.86 
 
 
247 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11275  hypothetical protein  45.58 
 
 
262 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0967945 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30680  hypothetical protein  43.14 
 
 
274 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1985  hypothetical protein  43.9 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2840  hypothetical protein  40 
 
 
237 aa  126  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.441542  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0540  hypothetical protein  40.76 
 
 
268 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0783  hypothetical protein  44.93 
 
 
291 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5930  hypothetical protein  43.9 
 
 
242 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0670577 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12750  hypothetical protein  34.85 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2856  hypothetical protein  41.63 
 
 
262 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0312  hypothetical protein  40.57 
 
 
288 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01700  hypothetical protein  38.54 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0802  hypothetical protein  32.99 
 
 
222 aa  72.4  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2914  hypothetical protein  24.87 
 
 
218 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4117  hypothetical protein  23.64 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17150  hypothetical protein  35.43 
 
 
237 aa  44.3  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.059036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0635  hypothetical protein  29.09 
 
 
223 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>