21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1985 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1985  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30680  hypothetical protein  53.59 
 
 
274 aa  219  3e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2840  hypothetical protein  52.83 
 
 
237 aa  191  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.441542  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0783  hypothetical protein  47.85 
 
 
291 aa  169  3e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1885  hypothetical protein  43.9 
 
 
243 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2856  hypothetical protein  39.76 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.439576 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4476  hypothetical protein  35.45 
 
 
247 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0213955  normal  0.520841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5930  hypothetical protein  38.1 
 
 
242 aa  122  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0670577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3972  hypothetical protein  34.09 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4046  hypothetical protein  34.09 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3986  hypothetical protein  34.09 
 
 
252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132001  normal  0.269494 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0540  hypothetical protein  31.38 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2219  hypothetical protein  36.19 
 
 
247 aa  108  9.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1212  hypothetical protein  38.33 
 
 
251 aa  103  4e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0125049  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0312  hypothetical protein  33.78 
 
 
288 aa  96.3  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12750  hypothetical protein  29.56 
 
 
250 aa  95.5  7e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11275  hypothetical protein  31.55 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0967945 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01700  hypothetical protein  33.78 
 
 
289 aa  82  0.000000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0802  hypothetical protein  31.51 
 
 
222 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2914  hypothetical protein  23.04 
 
 
218 aa  50.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4117  hypothetical protein  25.54 
 
 
254 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>