36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4846 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4846  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 163 aa  318  3e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0382463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  61.05 
 
 		 160 aa  196  9e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  60.84 
 
 		 151 aa  180  9.000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.067849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3462  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.23 
 
 		 156 aa  114  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127243  hitchhiker  0.000478856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1920  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  39.44 
 
 		 164 aa  93.2  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3690  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.67 
 
 		 139 aa  84.7  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.498919  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0975  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.56 
 
 		 178 aa  77  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241717 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8302  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3754  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.56 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7707  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.36 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0560  putative anti-sigma factor  37.06 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2904  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 141 aa  71.2  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3330  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35 
 
 		 149 aa  70.1  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3792  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.87 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0565  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.62 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3691  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.79 
 
 		 141 aa  63.5  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5160  hypothetical protein  31.91 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5362  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.65 
 
 		 145 aa  58.9  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1716  anti-sigma factor  32.2 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4078  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3698  hypothetical protein  32.17 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01800  hypothetical protein  30.91 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.612102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31970  hypothetical protein  34.17 
 
 		 127 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0256245  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2113  hypothetical protein  31.58 
 
 		 165 aa  44.3  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719777  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 142 aa  42  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  28.57 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  28.57 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  28.57 
 
 		 160 aa  42  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2974  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.84 
 
 		 151 aa  42  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  28.57 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  28.57 
 
 		 160 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  28.57 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  28.57 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  28.57 
 
 		 160 aa  41.6  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  28.57 
 
 		 160 aa  40.8  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11360  hypothetical protein  28.12 
 
 		 147 aa  40.4  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.965322 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>