51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3698 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3698  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  259  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4078  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  92.42 
 
 		 134 aa  218  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3690  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  55.3 
 
 		 139 aa  128  3e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.498919  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7707  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  52.9 
 
 		 145 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3691  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  54.41 
 
 		 141 aa  120  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0560  putative anti-sigma factor  53.68 
 
 		 141 aa  121  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8302  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  54.55 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0975  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  54.17 
 
 		 178 aa  111  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241717 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3754  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  52.5 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2904  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  51.47 
 
 		 141 aa  106  9.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0565  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50.83 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3792  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  52 
 
 		 139 aa  103  9e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1716  anti-sigma factor  55.21 
 
 		 143 aa  97.1  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5160  hypothetical protein  44.92 
 
 		 130 aa  86.3  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5362  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01800  hypothetical protein  37.61 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.612102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.8 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.067849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31970  hypothetical protein  42 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0256245  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3330  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.84 
 
 		 149 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1920  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  30.89 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2113  hypothetical protein  37.25 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4846  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.17 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0382463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11360  hypothetical protein  37.04 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  35.14 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  35.14 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  35.14 
 
 		 160 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  34.72 
 
 		 160 aa  57  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  34.72 
 
 		 160 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  33.78 
 
 		 160 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  35.14 
 
 		 160 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  33.78 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  33.78 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  33.78 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2899  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.43 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0642397  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3462  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127243  hitchhiker  0.000478856 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  36.99 
 
 		 162 aa  53.5  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0436  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.87 
 
 		 118 aa  51.6  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1309  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 179 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1280  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0849133  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1297  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 179 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4790  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.83 
 
 		 163 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1659  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.15 
 
 		 163 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5398  hypothetical protein  34.25 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169199  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13316  anti-sigma factor rsbW (sigma negative effector)  32.71 
 
 		 208 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0008  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000743678  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  25.77 
 
 		 159 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  25.77 
 
 		 159 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4099  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256347  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3289  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  54.29 
 
 		 147 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615968  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>