52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0560 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0560  putative anti-sigma factor  100 
 
 		 141 aa  275  2e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3691  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  88.57 
 
 		 141 aa  242  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3690  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  79.67 
 
 		 139 aa  198  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.498919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8302  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  69.12 
 
 		 141 aa  177  2.9999999999999997e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2904  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  63.97 
 
 		 141 aa  167  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7707  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  70.91 
 
 		 145 aa  149  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3754  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  60.94 
 
 		 178 aa  148  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0975  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  60.16 
 
 		 178 aa  142  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241717 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0565  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  55.15 
 
 		 138 aa  134  4e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3698  hypothetical protein  56.36 
 
 		 133 aa  110  7.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4078  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  52.21 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1716  anti-sigma factor  55 
 
 		 143 aa  103  1e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3792  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  58.42 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01800  hypothetical protein  35.07 
 
 		 172 aa  87.8  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.612102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5362  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.42 
 
 		 145 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.64 
 
 		 160 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5160  hypothetical protein  45.71 
 
 		 130 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.42 
 
 		 151 aa  74.7  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.067849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4846  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.06 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0382463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2113  hypothetical protein  40.4 
 
 		 165 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1920  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  34.86 
 
 		 164 aa  63.5  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31970  hypothetical protein  37.5 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0256245  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11360  hypothetical protein  31.58 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3330  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.9 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3462  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.54 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127243  hitchhiker  0.000478856 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1659  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.4 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4790  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34 
 
 		 163 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  31.17 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  31.08 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  31.08 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  29.87 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  33.96 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  33.96 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  33.96 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  33.96 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  33.96 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1280  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0849133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1309  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 179 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1297  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32 
 
 		 179 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  33.96 
 
 		 160 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0436  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 		 118 aa  49.7  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0008  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000743678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  32 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13316  anti-sigma factor rsbW (sigma negative effector)  33.04 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5398  hypothetical protein  31.9 
 
 		 122 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07010  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 		 143 aa  48.5  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  30 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  30 
 
 		 159 aa  45.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2899  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.33 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0642397  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  28.75 
 
 		 159 aa  42.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>