39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3330 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3330  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 149 aa  295  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1920  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  35.83 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.067849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0975  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.88 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3690  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.59 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.498919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3754  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  35.2 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4846  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0382463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3462  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127243  hitchhiker  0.000478856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7707  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.64 
 
 		 145 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2904  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.17 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8302  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.6 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0560  putative anti-sigma factor  35.9 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0565  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.43 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3698  hypothetical protein  40.43 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4078  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.43 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  26.39 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  26.39 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  25.69 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01800  hypothetical protein  35.64 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.612102 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3691  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  25.69 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  25.69 
 
 		 160 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  36.29 
 
 		 162 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  25.69 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  25.69 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  25.69 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  25.69 
 
 		 160 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1716  anti-sigma factor  33 
 
 		 143 aa  50.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  25.55 
 
 		 160 aa  50.1  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3792  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.54 
 
 		 139 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5362  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11360  hypothetical protein  29.03 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0436  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.2 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  23.08 
 
 		 128 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5160  hypothetical protein  36.23 
 
 		 130 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2974  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.3 
 
 		 151 aa  42  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31970  hypothetical protein  31.73 
 
 		 127 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0256245  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5398  hypothetical protein  27.27 
 
 		 122 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>