44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5160 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_5160  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  256  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3690  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  47.66 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.498919  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0565  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.87 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7707  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.87 
 
 		 145 aa  80.1  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4078  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  47.42 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0975  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  46.43 
 
 		 178 aa  79.3  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241717 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2904  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.28 
 
 		 141 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3698  hypothetical protein  47.42 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3754  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  44.14 
 
 		 178 aa  77.4  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8302  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  47.62 
 
 		 141 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3691  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.23 
 
 		 141 aa  76.6  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3792  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.71 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0560  putative anti-sigma factor  45.71 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1716  anti-sigma factor  41.23 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5362  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.18 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.82 
 
 		 160 aa  62  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01800  hypothetical protein  36.92 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.612102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.65 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.067849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31970  hypothetical protein  37.76 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0256245  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4846  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.28 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0382463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2113  hypothetical protein  37.86 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3462  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 		 156 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127243  hitchhiker  0.000478856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1920  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  31.96 
 
 		 164 aa  47.4  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11360  hypothetical protein  35.29 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  27.84 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  27.84 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  27.84 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5398  hypothetical protein  31.82 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  27.84 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  27.84 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  27.84 
 
 		 160 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  27.84 
 
 		 160 aa  45.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  27.84 
 
 		 160 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  25.77 
 
 		 160 aa  44.3  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3330  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.23 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  27.84 
 
 		 160 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0436  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.25 
 
 		 118 aa  43.5  0.0009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  25.49 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  25.49 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.61 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  29.03 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1297  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1280  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 		 179 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0849133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1309  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 		 179 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.729439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>