44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7187 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 160 aa  319  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  78.12 
 
 		 151 aa  222  2e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.067849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4846  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  60.47 
 
 		 163 aa  184  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0382463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3462  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  46.36 
 
 		 156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127243  hitchhiker  0.000478856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1920  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  40.77 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3330  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.81 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3690  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.76 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.498919  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8302  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 		 141 aa  81.3  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0975  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.64 
 
 		 178 aa  80.5  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7707  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.69 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0560  putative anti-sigma factor  39.64 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3754  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  33.33 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2904  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.85 
 
 		 141 aa  73.9  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139712  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3691  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.15 
 
 		 141 aa  73.2  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3792  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.64 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0565  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.38 
 
 		 138 aa  65.5  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01800  hypothetical protein  32.52 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.612102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5362  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 145 aa  63.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5160  hypothetical protein  34.82 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1716  anti-sigma factor  30.4 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3698  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4078  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.23 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31970  hypothetical protein  37.29 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0256245  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11360  hypothetical protein  35.65 
 
 		 147 aa  53.5  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  32.14 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5398  hypothetical protein  30.95 
 
 		 122 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  32.14 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  32.14 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  32.14 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  32.14 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  32.14 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  32.14 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  32.14 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  32.14 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1659  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 163 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  32.14 
 
 		 160 aa  47.4  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2113  hypothetical protein  31.9 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719777  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.78 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0702822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  26.32 
 
 		 162 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4790  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.06 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  25.77 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  25.77 
 
 		 159 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13316  anti-sigma factor rsbW (sigma negative effector)  29.41 
 
 		 208 aa  41.2  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.8 
 
 		 142 aa  40.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.477606 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>