47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5362 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5362  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 145 aa  287  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01800  hypothetical protein  45.53 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.612102 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31970  hypothetical protein  44.12 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0256245  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2113  hypothetical protein  46.46 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719777  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7707  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.24 
 
 		 145 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3691  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.62 
 
 		 141 aa  84.7  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0975  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.5 
 
 		 178 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11360  hypothetical protein  36.8 
 
 		 147 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2904  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.44 
 
 		 141 aa  80.5  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8302  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  41.23 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3792  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.54 
 
 		 139 aa  80.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3754  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  40.15 
 
 		 178 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0560  putative anti-sigma factor  42.42 
 
 		 141 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1716  anti-sigma factor  40.59 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3690  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.78 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.498919  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4078  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.57 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0565  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.84 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5398  hypothetical protein  39.81 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169199  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3698  hypothetical protein  44.57 
 
 		 133 aa  72  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.62 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.067849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5160  hypothetical protein  41.18 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1280  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0849133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1309  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1297  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4790  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.66 
 
 		 163 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1659  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.1 
 
 		 163 aa  62.8  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 160 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4294  hypothetical protein  31.2 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1920  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  30.71 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13316  anti-sigma factor rsbW (sigma negative effector)  38.39 
 
 		 208 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3462  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127243  hitchhiker  0.000478856 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4846  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.78 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0382463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3330  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  25.21 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  24.37 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  24.37 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  24.37 
 
 		 160 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2899  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25.42 
 
 		 130 aa  48.5  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0642397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  24.37 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  24.37 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  24.37 
 
 		 160 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  24.37 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  35.85 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  35.85 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  29.46 
 
 		 162 aa  43.9  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.65 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  43.64 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>