44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2113 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2113  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  329  9e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.719777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5362  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  46.46 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7707  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.37 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.756748 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01800  hypothetical protein  41.58 
 
 		 172 aa  73.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.612102 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0565  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.82 
 
 		 138 aa  72.8  0.000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3691  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 141 aa  69.7  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.222399 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31970  hypothetical protein  40.59 
 
 		 127 aa  70.5  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0256245  normal  0.117243 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0560  putative anti-sigma factor  40.4 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3792  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.05 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8302  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.61 
 
 		 141 aa  67  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.961553  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2904  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.62 
 
 		 141 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3690  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.498919  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3754  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  31.67 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3698  hypothetical protein  38.04 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1659  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4078  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.04 
 
 		 134 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0634839 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4294  hypothetical protein  36.08 
 
 		 146 aa  58.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00886723  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1309  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.26 
 
 		 179 aa  57.8  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.729439 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1297  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.15459  normal  0.0696022 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1716  anti-sigma factor  34.91 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1280  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0849133  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5160  hypothetical protein  37.86 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.319587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4790  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.24 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0975  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.63 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.241717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11360  hypothetical protein  37.86 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1920  putative serine/threonine kinase anti-sigma factor  32.04 
 
 		 164 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  23.2 
 
 		 160 aa  48.5  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  23.2 
 
 		 160 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13316  anti-sigma factor rsbW (sigma negative effector)  34.26 
 
 		 208 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  24 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  23.44 
 
 		 160 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 		 147 aa  47.4  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2899  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  19.86 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0642397  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  22.66 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7187  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.9 
 
 		 160 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3462  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.45 
 
 		 156 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.127243  hitchhiker  0.000478856 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  22.66 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  22.66 
 
 		 160 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  22.66 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  22.66 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 151 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.067849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  21.88 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5398  hypothetical protein  31.68 
 
 		 122 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4846  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 		 163 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0382463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>